127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0931 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  90.62 
 
 		 64 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  96.36 
 
 		 55 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  84.62 
 
 		 65 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  81.54 
 
 		 65 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 65 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  75.76 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  76.92 
 
 		 64 aa  93.6  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  74.6 
 
 		 64 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  74.6 
 
 		 64 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  73.85 
 
 		 64 aa  92  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 66 aa  90.5  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3097  50S ribosomal protein L33  69.84 
 
 		 64 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  72.31 
 
 		 64 aa  87.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5172  50S ribosomal protein L33  72.31 
 
 		 64 aa  87  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.566722  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3728  50S ribosomal protein L33  70.49 
 
 		 62 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14791  50S ribosomal protein L33  68.18 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  67.19 
 
 		 60 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  64.06 
 
 		 60 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 60 aa  78.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 60 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  65.15 
 
 		 62 aa  78.2  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  60.94 
 
 		 60 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  61.54 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 60 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  60.94 
 
 		 59 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  58.46 
 
 		 60 aa  72  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 60 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  56.92 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  54.84 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0903  ribosomal protein L33  70.49 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.561223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  57.58 
 
 		 57 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  58.93 
 
 		 54 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1110  50S ribosomal protein L33  63.08 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1725  50S ribosomal protein L33  64.62 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1649  50S ribosomal protein L33  61.54 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000248156  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0975  50S ribosomal protein L33  59.38 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262128  normal  0.195912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  45.31 
 
 		 54 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  51.67 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 49 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 49 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 52 aa  48.5  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 52 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 52 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  41.27 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  39.66 
 
 		 49 aa  47.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 52 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  40.98 
 
 		 55 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 55 aa  47  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 55 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  42.19 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  48.28 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  40 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0095  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  41.94 
 
 		 54 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  38.1 
 
 		 54 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  43.1 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  42.62 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  42.19 
 
 		 56 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  40.62 
 
 		 55 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  46.55 
 
 		 49 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  39.66 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  39.66 
 
 		 49 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  43.1 
 
 		 49 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  39.06 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1361  50S ribosomal protein L33  60.61 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000386724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3334  50S ribosomal protein L33  34.92 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  39.39 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4246  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 57 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3595  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 57 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0317217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0361  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 57 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.129931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0379  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 57 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000434735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3479  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 57 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0464  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 57 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  37.5 
 
 		 56 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0378  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 57 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0390  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 57 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000114738  hitchhiker  0.0000558553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>