139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1029 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1029  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
54 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000770423  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1361  50S ribosomal protein L33  85.42 
 
 
49 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000386724  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2110  50S ribosomal protein L33  66.67 
 
 
49 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1954  50S ribosomal protein L33  66.67 
 
 
49 aa  64.3  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0076  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 
49 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000000689148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  54.17 
 
 
49 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  42.59 
 
 
54 aa  50.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  48.33 
 
 
60 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
49 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  48.33 
 
 
60 aa  50.1  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  42.59 
 
 
54 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  45 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  67.74 
 
 
55 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  67.74 
 
 
54 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  45 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 
49 aa  48.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 
49 aa  48.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  44.44 
 
 
56 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  67.74 
 
 
55 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  45.83 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 
49 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  46.81 
 
 
49 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 
49 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1210  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
49 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000860054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0160  ribosomal protein L33  64.52 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952295 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0816  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2854  50S ribosomal protein L33  60.61 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584525  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3150  50S ribosomal protein L33  40.38 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678006  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3181  50S ribosomal protein L33  38.89 
 
 
56 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  48.98 
 
 
54 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  46.94 
 
 
54 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  42.59 
 
 
56 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 
54 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  37.74 
 
 
56 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1996  ribosomal protein L33  40.74 
 
 
56 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.76258  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2904  50S ribosomal protein L33  60.61 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833747  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36490  LSU ribosomal protein L33P  61.29 
 
 
56 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.598182 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  41.07 
 
 
56 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4558  ribosomal protein L33  61.76 
 
 
57 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571438  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3855  ribosomal protein L33  61.29 
 
 
54 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346499  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0563  50S ribosomal protein L33  40.74 
 
 
54 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  45 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  42.59 
 
 
54 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  41.07 
 
 
56 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3144  50S ribosomal protein L33  44.23 
 
 
55 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0330752  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6648  ribosomal protein L33  44.9 
 
 
54 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  42.31 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  49.06 
 
 
57 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3184  ribosomal protein L33  39.29 
 
 
56 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0237332 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0145a  50S ribosomal protein L33  38.89 
 
 
56 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00313343  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  43.64 
 
 
55 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  39.29 
 
 
56 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3429  50S ribosomal protein L33  38.89 
 
 
56 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138945  normal  0.509764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1756  50S ribosomal protein L33  35.19 
 
 
56 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0226  50S ribosomal protein L33  61.29 
 
 
55 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289129  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5115  50S ribosomal protein L33  61.29 
 
 
54 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  40.74 
 
 
56 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  47.73 
 
 
54 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0286  50S ribosomal protein L33  58.06 
 
 
55 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184896  normal  0.0139935 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19180  50S ribosomal protein L33  61.29 
 
 
55 aa  43.5  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.154624  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3292  ribosomal protein L33  58.06 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  41.07 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  42.22 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1008  ribosomal protein L33  43.18 
 
 
54 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1311  50S ribosomal protein L33  58.06 
 
 
54 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0606  ribosomal protein L33  58.06 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6067  50S ribosomal protein L33  37.04 
 
 
54 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412873  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5366  50S ribosomal protein L33  35.19 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.410565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03530  LSU ribosomal protein L33P  43.18 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.748842  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  41.07 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  49.12 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  48.08 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  41.07 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3215  50S ribosomal protein L33  36.54 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3385  50S ribosomal protein L33  37.04 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.239871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1467  ribosomal protein L33  54.84 
 
 
54 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  39.58 
 
 
55 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  39.29 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7575  ribosomal protein L33  64.52 
 
 
54 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2723  50S ribosomal protein L33  37.04 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5490  50S ribosomal protein L33  54.84 
 
 
54 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211328  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  43.75 
 
 
49 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  41.54 
 
 
65 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  42.22 
 
 
49 aa  41.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2871  50S ribosomal protein L33  37.04 
 
 
56 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654658  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  40 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>