253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2854 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2854  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 55 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584525  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2904  50S ribosomal protein L33  96.36 
 
 		 55 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833747  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0226  50S ribosomal protein L33  81.82 
 
 		 55 aa  98.6  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289129  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0606  ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  97.1  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 		 55 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3292  ribosomal protein L33  80 
 
 		 54 aa  94  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0286  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 55 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184896  normal  0.0139935 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19180  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 55 aa  92.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.154624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3855  ribosomal protein L33  83.64 
 
 		 54 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5115  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 54 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1467  ribosomal protein L33  80 
 
 		 54 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234305  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1311  50S ribosomal protein L33  80.77 
 
 		 54 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5490  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 54 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211328  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4730  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 		 54 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4816  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 		 54 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.504852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36490  LSU ribosomal protein L33P  70.37 
 
 		 56 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.598182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0160  ribosomal protein L33  70.91 
 
 		 55 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 54 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7575  ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 54 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12094  50S ribosomal protein L33  83.64 
 
 		 54 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4558  ribosomal protein L33  55.36 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1278  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  70.5  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.415692  normal  0.0543847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3188  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  67.8  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1771  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2107  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.680646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1740  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.33138  normal  0.392054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 54 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6677  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1499  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.612868  normal  0.102067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1887  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.109266  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0670  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0534  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 56 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7415  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0365906  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3150  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678006  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2816  ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480398  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3860  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0816  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3576  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.870644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1225  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  63.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1915  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  63.9  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 51 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1350  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2780  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4292  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3026  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6091  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4153  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365361  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0063  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000004658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3958  ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0656644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4373  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.524051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3842  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4098  ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0806085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4840  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000872233  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3540  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4388  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00246794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70180  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0103  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00224042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0069  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000995391  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5281  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4559  50S ribosomal protein L33  43.64 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00166068  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4246  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0404  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000033956  hitchhiker  0.000000000114944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00655  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 56 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4114  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4007  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.207966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4061  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165182  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0189  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3944  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5332  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0390  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000114738  hitchhiker  0.0000558553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0387  50S ribosomal protein L33  43.64 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00101939  hitchhiker  0.000000105802 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2600  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.19047e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0328  50S ribosomal protein L33  43.64 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03445  hypothetical protein  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  48.98 
 
 		 51 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5006  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4053  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.247702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3826  50S ribosomal protein L33  43.64 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3768  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299368  normal  0.753148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0075  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000811631  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3835  50S ribosomal protein L33  43.64 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0015523  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4137  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000329563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3845  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.4911399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0378  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128986  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0847  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0388804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0161  ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.490413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5191  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.31848  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0379  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000434735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>