247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0226 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0226  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289129  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2854  50S ribosomal protein L33  81.82 
 
 		 55 aa  98.6  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584525  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0286  50S ribosomal protein L33  81.82 
 
 		 55 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184896  normal  0.0139935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2904  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833747  normal  0.633116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3722  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 55 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3920  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 55 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19180  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 55 aa  94  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.154624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0606  ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 55 aa  93.6  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3855  ribosomal protein L33  78.18 
 
 		 54 aa  89.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000346499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3292  ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 54 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5115  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 54 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0160  ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 55 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1311  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 54 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1467  ribosomal protein L33  70.91 
 
 		 54 aa  87.8  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234305  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36490  LSU ribosomal protein L33P  75.93 
 
 		 56 aa  87.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.598182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5490  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 54 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211328  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4730  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 54 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4816  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 54 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.504852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1556  ribosomal protein L33  70.91 
 
 		 54 aa  84.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0478864  decreased coverage  0.00911085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7575  ribosomal protein L33  70.91 
 
 		 54 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12094  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 54 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4558  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 57 aa  67  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1499  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.612868  normal  0.102067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3860  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3150  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678006  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0816  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0847  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0388804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2816  ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480398  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0670  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1887  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.109266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0534  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3026  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3842  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3576  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.870644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3540  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3188  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  58.49 
 
 		 54 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1350  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6677  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1771  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2107  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.680646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1278  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.415692  normal  0.0543847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1740  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.33138  normal  0.392054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2235  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.015241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3037  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0645  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.221759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 51 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1433  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7415  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0365906  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2441  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2780  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1225  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  51.06 
 
 		 51 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0574  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0609  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1751  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0927  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876477  normal  0.594251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2414  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.63565  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4738  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0328  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0387  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00101939  hitchhiker  0.000000105802 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1915  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3676  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0498554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3826  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4559  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00166068  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4292  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4246  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1291  50S ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070156  hitchhiker  0.00170848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3595  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0317217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0361  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.129931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  59.57 
 
 		 51 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1383  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.475862  normal  0.535543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3768  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299368  normal  0.753148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3835  50S ribosomal protein L33  45.28 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0015523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0378  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0390  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000114738  hitchhiker  0.0000558553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  48.08 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0379  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000434735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0404  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000033956  hitchhiker  0.000000000114944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0583  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2232  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1136  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2101  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.278945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0779  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0792  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.696109  normal  0.11426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2648  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417421  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  55.77 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1022  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.209918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0977  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0982  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.392597  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2781  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 55 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2947  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0049  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 51 aa  57.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>