196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4738 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4738  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 55 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1433  50S ribosomal protein L33  98.18 
 
 		 55 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2441  50S ribosomal protein L33  98.18 
 
 		 55 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2235  50S ribosomal protein L33  90.91 
 
 		 55 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.655052  normal  0.015241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2414  50S ribosomal protein L33  90.91 
 
 		 55 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.63565  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3540  50S ribosomal protein L33  90.91 
 
 		 55 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3037  50S ribosomal protein L33  89.09 
 
 		 55 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0609  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3676  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0498554  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0574  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1771  50S ribosomal protein L33  81.82 
 
 		 55 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1350  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 		 55 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1740  50S ribosomal protein L33  81.82 
 
 		 55 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.33138  normal  0.392054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2107  50S ribosomal protein L33  81.82 
 
 		 55 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.680646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0927  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876477  normal  0.594251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1751  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 55 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413593  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7415  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 55 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0365906  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1383  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 55 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.475862  normal  0.535543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1291  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 55 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070156  hitchhiker  0.00170848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3576  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 55 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.870644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6677  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 		 55 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0847  50S ribosomal protein L33  74.55 
 
 		 55 aa  90.5  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0388804  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2947  50S ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 55 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2816  ribosomal protein L33  76.36 
 
 		 55 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480398  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3860  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 		 55 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2781  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 55 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.690161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1278  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 55 aa  85.5  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.415692  normal  0.0543847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3188  50S ribosomal protein L33  70.91 
 
 		 55 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2780  50S ribosomal protein L33  70.91 
 
 		 55 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1499  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 55 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.612868  normal  0.102067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1225  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 55 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0147  50S ribosomal protein L33  70.91 
 
 		 55 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0204483  normal  0.0145707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3026  50S ribosomal protein L33  70.91 
 
 		 55 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3842  50S ribosomal protein L33  69.09 
 
 		 55 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1915  50S ribosomal protein L33  69.09 
 
 		 55 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4292  50S ribosomal protein L33  67.27 
 
 		 55 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1887  50S ribosomal protein L33  65.45 
 
 		 55 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.109266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0534  50S ribosomal protein L33  65.45 
 
 		 55 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0670  50S ribosomal protein L33  65.45 
 
 		 55 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0039  50S ribosomal protein L33  65.45 
 
 		 55 aa  77.4  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0161  ribosomal protein L33  63.64 
 
 		 55 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.490413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3205  50S ribosomal protein L33P  61.82 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 		 55 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2641  ribosomal protein L33  68.75 
 
 		 51 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3958  ribosomal protein L33  61.82 
 
 		 55 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0656644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0816  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  68.75 
 
 		 51 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3150  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678006  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4153  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0063  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000004658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4388  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00246794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4840  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000872233  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4098  ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0806085  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0103  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00224042  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03493  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0069  ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000995391  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2340  50S ribosomal protein L33  66.67 
 
 		 51 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4061  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5006  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3845  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.4911399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3835  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0015523  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3926  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0224319  hitchhiker  0.00115915 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0075  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000811631  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3971  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000410217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4053  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.247702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03445  hypothetical protein  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3944  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019564  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4137  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000329563  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4114  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4007  50S ribosomal protein L33  58.18 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.207966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1996  ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 56 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.76258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2022  ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000144183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0049  50S ribosomal protein L33  64.58 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.754437  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0145a  50S ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 56 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00313343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0190  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2600  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.19047e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4559  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00166068  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0328  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3826  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  64.58 
 
 		 51 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3385  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 56 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.239871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2723  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 56 aa  62  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3479  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0387  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 57 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00101939  hitchhiker  0.000000105802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0464  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000104252  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2232  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1136  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540244  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0779  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0583  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1022  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.209918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0977  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0982  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.392597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2101  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 55 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.278945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>