217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4558 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4558  ribosomal protein L33  100 
 
 		 57 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0630  ribosomal protein L33  67.92 
 
 		 56 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3950  50S ribosomal protein L33  71.43 
 
 		 54 aa  77  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0816  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3150  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.678006  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5835  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2970  50S ribosomal protein L33P  71.43 
 
 		 51 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0374037  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1892  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2550  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2503  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.638858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2421  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170967  hitchhiker  0.000857302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2528  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0324  50S ribosomal protein L33  66.04 
 
 		 55 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3566  ribosomal protein L33  69.39 
 
 		 51 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0250146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2313  ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 56 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5281  50S ribosomal protein L33  71.43 
 
 		 51 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5191  50S ribosomal protein L33  71.43 
 
 		 51 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.31848  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5332  50S ribosomal protein L33  71.43 
 
 		 51 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48040  50S ribosomal protein L33  71.43 
 
 		 51 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1996  ribosomal protein L33  60.38 
 
 		 56 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.76258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4373  50S ribosomal protein L33  71.43 
 
 		 51 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.524051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0189  50S ribosomal protein L33  71.43 
 
 		 51 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00056  50S ribosomal protein L33  69.39 
 
 		 51 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000125174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0145a  50S ribosomal protein L33  67.31 
 
 		 56 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00313343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3181  50S ribosomal protein L33  62.26 
 
 		 56 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  67.35 
 
 		 51 aa  73.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5536  50S ribosomal protein L33  69.39 
 
 		 51 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2641  ribosomal protein L33  69.39 
 
 		 51 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3144  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0330752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4137  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000329563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03493  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0069  ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000995391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3926  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0224319  hitchhiker  0.00115915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4840  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000872233  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5006  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000892667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03239  50S ribosomal protein L33  66.04 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4153  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0103  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00224042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0057  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4061  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165182  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4007  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.207966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0075  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000811631  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0063  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000004658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3971  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000410217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3845  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.4911399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4053  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.247702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0752  ribosomal protein L33  66.04 
 
 		 56 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525101 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4114  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0233686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0161  ribosomal protein L33  63.46 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.490413  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3944  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.019564  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03445  hypothetical protein  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4388  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00246794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4098  ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0806085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0090  ribosomal protein L33  69.39 
 
 		 51 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0225  50S ribosomal protein L33  69.39 
 
 		 51 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2723  50S ribosomal protein L33  62.26 
 
 		 56 aa  72  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3188  50S ribosomal protein L33  66.67 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3958  ribosomal protein L33  63.46 
 
 		 55 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0656644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3215  50S ribosomal protein L33  63.46 
 
 		 55 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3385  50S ribosomal protein L33  62.26 
 
 		 56 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.239871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2600  50S ribosomal protein L33  64.15 
 
 		 55 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.19047e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3835  50S ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 57 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0015523  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2734  50S ribosomal protein L33  60.38 
 
 		 56 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2871  50S ribosomal protein L33  60.38 
 
 		 56 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0654658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2022  ribosomal protein L33  65.31 
 
 		 51 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000144183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2340  50S ribosomal protein L33  65.31 
 
 		 51 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0328  50S ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 57 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1252  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 55 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3826  50S ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 57 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4559  50S ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 57 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00166068  hitchhiker  0.00000473608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0387  50S ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 57 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00101939  hitchhiker  0.000000105802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3429  50S ribosomal protein L33  62.26 
 
 		 56 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138945  normal  0.509764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2446  50S ribosomal protein L33  60.38 
 
 		 56 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0404  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000033956  hitchhiker  0.000000000114944 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4246  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0378  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128986  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2714  50S ribosomal protein L33  60.38 
 
 		 56 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2324  50S ribosomal protein L33  60.38 
 
 		 56 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0390  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000114738  hitchhiker  0.0000558553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3595  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0317217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0361  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.129931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1281  ribosomal protein L33  60.38 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6677  50S ribosomal protein L33  67.31 
 
 		 55 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2854  50S ribosomal protein L33  55.36 
 
 		 55 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584525  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3768  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.299368  normal  0.753148 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0379  50S ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 57 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000434735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36490  LSU ribosomal protein L33P  58.93 
 
 		 56 aa  70.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.598182 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1735  50S ribosomal protein L33  57.69 
 
 		 55 aa  70.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0639577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00655  50S ribosomal protein L33  63.16 
 
 		 56 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3842  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001819  LSU ribosomal protein L33p  63.16 
 
 		 56 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000810994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0190  50S ribosomal protein L33  60.38 
 
 		 55 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3026  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  70.1  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0547  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 54 aa  70.1  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0482  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 54 aa  70.1  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2232  50S ribosomal protein L33  59.62 
 
 		 55 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2590  50S ribosomal protein L33P  61.54 
 
 		 55 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.493665  normal  0.155202 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1136  50S ribosomal protein L33  59.62 
 
 		 55 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.540244  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1771  50S ribosomal protein L33  65.38 
 
 		 55 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3479  50S ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 57 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0020759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>