164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1386 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 49 aa  100  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  69.39 
 
 		 49 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 49 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 49 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 49 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 49 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 49 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 49 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 49 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  65.31 
 
 		 49 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  65.31 
 
 		 49 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 49 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1210  50S ribosomal protein L33  63.27 
 
 		 49 aa  66.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000860054  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  64.44 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  53.33 
 
 		 56 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0672  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 48 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000072872  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1484  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 48 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000298588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 54 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  62.22 
 
 		 54 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  64.44 
 
 		 49 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 55 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0694  50S ribosomal protein L33  53.19 
 
 		 48 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0119  ribosomal protein L33  60.47 
 
 		 43 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491722  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  57.78 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  61.22 
 
 		 55 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 55 aa  53.9  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 56 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  53.85 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  53.33 
 
 		 56 aa  53.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  53.33 
 
 		 54 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  50 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  51.02 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  53.33 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  48.89 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  48.89 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2079  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.958613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  53.06 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  46.94 
 
 		 49 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1361  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000386724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  53.33 
 
 		 54 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0251  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3184  ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0237332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 54 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  48.89 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  46.94 
 
 		 49 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 52 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  46.15 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 54 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 50 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  44.23 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 50 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2428  50S ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000103029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  43.48 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  48.89 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  46.94 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  50 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1029  50S ribosomal protein L33  46.81 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000770423  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  45.65 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  51.11 
 
 		 52 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0833  50S ribosomal protein L33P  42.86 
 
 		 51 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000169832  normal  0.0907475 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>