234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0518 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  100 
 
 		 49 aa  97.8  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  93.88 
 
 		 49 aa  94.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  67.35 
 
 		 57 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  59.18 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  58.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  57.14 
 
 		 49 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  51.02 
 
 		 49 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  57  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  50 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3696  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000370683  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  48.15 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  53.06 
 
 		 52 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  45.45 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  47.83 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0251  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  51.85 
 
 		 54 aa  50.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  48.98 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  48.98 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 54 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  46.94 
 
 		 49 aa  48.9  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1210  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000860054  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2110  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3334  50S ribosomal protein L33  48.94 
 
 		 54 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  46.94 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0311  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 51 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000251757  normal  0.219497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  51.02 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1361  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00000386724  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1954  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  48.9  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0271  50S ribosomal protein L33  44.9 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000825725  hitchhiker  0.00763041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0346  ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 52 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000103614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  36.73 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  45.28 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  46.81 
 
 		 54 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  36.73 
 
 		 54 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2340  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 51 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2641  ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 51 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2022  ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 51 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000144183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  42.86 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  38.78 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  40.82 
 
 		 54 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  46.94 
 
 		 52 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2734  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2642  50S ribosomal protein L33P  42.86 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2349  ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0078385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>