208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0887 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  100 
 
 		 55 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 55 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  98.18 
 
 		 55 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  61.82 
 
 		 55 aa  73.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  64.58 
 
 		 49 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  66.67 
 
 		 49 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  60 
 
 		 55 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 56 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  59.26 
 
 		 56 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  66.67 
 
 		 49 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  63.64 
 
 		 54 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  70.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  64.58 
 
 		 49 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  64.58 
 
 		 49 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  60.71 
 
 		 56 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 54 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  57.41 
 
 		 56 aa  67.8  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  53.7 
 
 		 56 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  67.4  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  55.56 
 
 		 56 aa  67  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  60.78 
 
 		 54 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  58.82 
 
 		 54 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  58.82 
 
 		 54 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10647  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 55 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0308205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  53.7 
 
 		 56 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0119  ribosomal protein L33  67.44 
 
 		 43 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491722  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0737  ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  65.1  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 56 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0271  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000825725  hitchhiker  0.00763041 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  54 
 
 		 52 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0917  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166637  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 49 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0934  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6648  ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 54 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  54.9 
 
 		 54 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3184  ribosomal protein L33  53.7 
 
 		 56 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0237332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1105  ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.184146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1229  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0945  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5122  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6067  50S ribosomal protein L33  58.82 
 
 		 54 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412873  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 49 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  56.86 
 
 		 54 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0563  50S ribosomal protein L33  56.86 
 
 		 54 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  52.08 
 
 		 49 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  58.33 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 49 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09700  LSU ribosomal protein L33P  54.17 
 
 		 49 aa  60.1  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000620955  hitchhiker  0.00000511825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 50 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 50 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1210  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000860054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03530  LSU ribosomal protein L33P  50.98 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.748842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5101  ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299786  normal  0.585671 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1008  ribosomal protein L33  50.98 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 49 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 54 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  57  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1484  50S ribosomal protein L33  48.94 
 
 		 48 aa  56.2  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000298588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  52.94 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  50 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1386  50S ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  2.61709e-16  hitchhiker  2.76351e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  49.02 
 
 		 54 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0672  50S ribosomal protein L33  44.68 
 
 		 48 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000072872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>