171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1110 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1110  50S ribosomal protein L33  100 
 
 
60 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  95 
 
 
60 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  91.67 
 
 
60 aa  114  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1649  50S ribosomal protein L33  95 
 
 
60 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000248156  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  81.67 
 
 
59 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1725  50S ribosomal protein L33  95 
 
 
60 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  76.47 
 
 
54 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  67.21 
 
 
61 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0975  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 
59 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262128  normal  0.195912 
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  67.8 
 
 
62 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  63.08 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  63.08 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  61.54 
 
 
64 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  60.94 
 
 
64 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  56.67 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  63.93 
 
 
60 aa  70.5  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  63.93 
 
 
60 aa  70.1  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  65.57 
 
 
60 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  59.38 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  62.3 
 
 
60 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  60.34 
 
 
57 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  65.57 
 
 
60 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  62.3 
 
 
61 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  65.57 
 
 
60 aa  68.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3728  50S ribosomal protein L33  59.38 
 
 
62 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  63.64 
 
 
55 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5172  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.566722  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  59.09 
 
 
65 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  54.69 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  54.69 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 
65 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3097  50S ribosomal protein L33  54.69 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0095  50S ribosomal protein L33  61.82 
 
 
57 aa  64.3  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  60.66 
 
 
60 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14791  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 
66 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  60.38 
 
 
55 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  50.94 
 
 
49 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  54.72 
 
 
49 aa  55.1  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3334  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 
54 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178171  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1008  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 
54 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0013488  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  52.83 
 
 
49 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  52.54 
 
 
54 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  50.1  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 
52 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 
52 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0903  ribosomal protein L33  57.81 
 
 
62 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.561223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 
50 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2079  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 
49 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.958613  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 
52 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  54.72 
 
 
50 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  50 
 
 
56 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  45 
 
 
55 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 
49 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 
52 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3241  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 
54 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.373384  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  50.94 
 
 
49 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  47.17 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  46.67 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  42.37 
 
 
56 aa  48.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  45.28 
 
 
49 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 
49 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  44.64 
 
 
54 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 
49 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 
49 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  47  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  50 
 
 
49 aa  47  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 
55 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  43.86 
 
 
54 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  48.28 
 
 
59 aa  47  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 
55 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  50.94 
 
 
49 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  41.67 
 
 
54 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  52 
 
 
49 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  41.51 
 
 
49 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  47.17 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  41.67 
 
 
54 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  47.17 
 
 
49 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  47.17 
 
 
49 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0346  ribosomal protein L33  48 
 
 
52 aa  45.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000103614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  49.06 
 
 
49 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 
49 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1542  50S ribosomal protein L33  47.17 
 
 
49 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  normal  0.759054 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  40 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2132  ribosomal protein L33  45.28 
 
 
49 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0045011  normal  0.563046 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>