183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1338 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 64 aa  129  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  90.62 
 
 		 64 aa  118  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14791  50S ribosomal protein L33  89.39 
 
 		 66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  79.69 
 
 		 64 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  84.85 
 
 		 66 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5172  50S ribosomal protein L33  79.69 
 
 		 64 aa  110  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.566722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  82.81 
 
 		 64 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3097  50S ribosomal protein L33  81.25 
 
 		 64 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  82.81 
 
 		 64 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3728  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 62 aa  102  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  80.3 
 
 		 65 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  78.79 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  71.21 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  77.27 
 
 		 65 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  76.92 
 
 		 64 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  76.92 
 
 		 64 aa  93.6  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  73.85 
 
 		 64 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0903  ribosomal protein L33  85 
 
 		 62 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.561223 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  78.18 
 
 		 55 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  57.81 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  57.81 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  49.21 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  54.69 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  53.85 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  57.81 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 60 aa  63.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 60 aa  63.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  55.93 
 
 		 54 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  57.81 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  53.12 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  51.56 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  51.56 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  48.33 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  51.72 
 
 		 55 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  45.31 
 
 		 55 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  46.77 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  57.8  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 55 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  49.15 
 
 		 54 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 55 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 55 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  53.12 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  47.62 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  45.31 
 
 		 55 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  48.33 
 
 		 54 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  44.44 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 54 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1725  50S ribosomal protein L33  60.94 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  48.28 
 
 		 49 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  46.15 
 
 		 56 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1229  50S ribosomal protein L33  48.39 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1105  ribosomal protein L33  48.39 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.184146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5122  50S ribosomal protein L33  48.39 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  44.44 
 
 		 56 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  46.88 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  48.28 
 
 		 52 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 52 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1110  50S ribosomal protein L33  59.38 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  41.38 
 
 		 49 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 52 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1649  50S ribosomal protein L33  59.38 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000248156  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  45.31 
 
 		 55 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  45.31 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  48.28 
 
 		 49 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  47.46 
 
 		 54 aa  50.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  42.86 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10647  50S ribosomal protein L33  43.75 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0308205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  42.86 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  42.86 
 
 		 56 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 49 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  46.55 
 
 		 49 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  43.1 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  44.83 
 
 		 49 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0917  50S ribosomal protein L33  45.16 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>