37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0095 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0095  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 57 aa  116  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  60 
 
 		 54 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  58.49 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  58.49 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  60.38 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  58.49 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  58.49 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  56.6 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  61.54 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  56.6 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  50.94 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  52.83 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  49.06 
 
 		 60 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1110  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  49.12 
 
 		 50 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  49.12 
 
 		 50 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1649  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000248156  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0518  ribosomal protein L33  51.92 
 
 		 49 aa  45.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1725  50S ribosomal protein L33  56.36 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2956  ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000537261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 49 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  42.11 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 49 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 49 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  47.27 
 
 		 49 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  44.26 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 49 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  46.43 
 
 		 54 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 49 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  48.08 
 
 		 49 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>