156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1136 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 66 aa  135  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  83.33 
 
 		 66 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  84.85 
 
 		 65 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  84.85 
 
 		 64 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  81.82 
 
 		 65 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  80.3 
 
 		 64 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  78.79 
 
 		 65 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14791  50S ribosomal protein L33  80.3 
 
 		 66 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  71.21 
 
 		 64 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  71.21 
 
 		 64 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  75.76 
 
 		 64 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  75.76 
 
 		 64 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  71.21 
 
 		 64 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5172  50S ribosomal protein L33  71.21 
 
 		 64 aa  94  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.566722  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 64 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3097  50S ribosomal protein L33  69.7 
 
 		 64 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3728  50S ribosomal protein L33  67.74 
 
 		 62 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  75 
 
 		 55 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  59.09 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0903  ribosomal protein L33  74.19 
 
 		 62 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.561223 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  53.85 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  56.72 
 
 		 62 aa  70.1  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  57.58 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 60 aa  66.6  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  56.06 
 
 		 60 aa  66.6  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  56.06 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  51.52 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  53.03 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  56.06 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  53.03 
 
 		 61 aa  63.5  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  53.03 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  50 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  50.82 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  51.52 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  43.94 
 
 		 55 aa  57  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  48.33 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  47.54 
 
 		 54 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  48.33 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  48.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  48.33 
 
 		 52 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  46.88 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  43.08 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 52 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 52 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  40.91 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  43.94 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  41.54 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  39.39 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  39.39 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0119  ribosomal protein L33  50 
 
 		 43 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4590  ribosomal protein L33  50.88 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  39.39 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1110  50S ribosomal protein L33  57.58 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  45 
 
 		 49 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  40.32 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  45.16 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  40 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  40 
 
 		 56 aa  51.2  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  45 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 49 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  39.39 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  39.39 
 
 		 55 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1725  50S ribosomal protein L33  56.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1649  50S ribosomal protein L33  56.06 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000248156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  37.88 
 
 		 55 aa  50.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  40.98 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  40.3 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1210  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000860054  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  38.46 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  38.46 
 
 		 56 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1229  50S ribosomal protein L33  42.19 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5122  50S ribosomal protein L33  42.19 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1105  ribosomal protein L33  42.19 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.184146  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  38.33 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0346  ribosomal protein L33  41.07 
 
 		 52 aa  47  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000103614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>