249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1671 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 56 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 52 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  78 
 
 		 52 aa  89.4  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 52 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  80 
 
 		 52 aa  89.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0346  ribosomal protein L33  81.63 
 
 		 52 aa  85.5  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000103614  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1324  50S ribosomal protein L33  81.13 
 
 		 55 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000050191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3067  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212936  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1396  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000827111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1423  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  63.9  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000766493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4424  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4240  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4475  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4570  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0775  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.089249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0119  ribosomal protein L33  62.79 
 
 		 43 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4421  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4462  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  54.55 
 
 		 54 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 54 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  52.73 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2079  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.958613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  47.69 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0446  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1448  50S ribosomal protein L33  62.5 
 
 		 49 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4531  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 54 aa  59.3  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  60.42 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0187  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 49 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1629  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3942  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 56 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1116  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0383  ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 54 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.192931  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2428  50S ribosomal protein L33  55.36 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000103029  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0398  50S ribosomal protein L33  59.57 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  57.4  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  49.09 
 
 		 55 aa  57  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0672  50S ribosomal protein L33  56.52 
 
 		 48 aa  57  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000072872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 56 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  50.91 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1951  ribosomal protein L33  55.32 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000159206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  48.21 
 
 		 56 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0356  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 54 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  43.08 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  54.24 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  43.08 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  51.67 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2729  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000221707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2415  50S ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 52 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000282582  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  47.92 
 
 		 56 aa  56.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  50.94 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  58.33 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  54.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1484  50S ribosomal protein L33  58.7 
 
 		 48 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000298588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1150  ribosomal protein L33  54.35 
 
 		 49 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000195312  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2667  50S ribosomal protein L33  46.3 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  51.67 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4364  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 54 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  48.33 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0484  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0469  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715634  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  48.33 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  56.25 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0740  ribosomal protein L33  48.15 
 
 		 54 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0850  50S ribosomal protein L33  55.1 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177081  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  45.16 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  45.16 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  50 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0639  50S ribosomal protein L33  54.17 
 
 		 49 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000258953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  53.33 
 
 		 49 aa  53.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  48.39 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  60 
 
 		 49 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  52.08 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  46.88 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  43.94 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  46.88 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2475  50S ribosomal protein L33P  56.25 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000110121  decreased coverage  0.000947094 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  45.83 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  55.56 
 
 		 55 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0271  50S ribosomal protein L33  52.08 
 
 		 49 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000825725  hitchhiker  0.00763041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>