147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14791 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_14791  50S ribosomal protein L33  100 
 
 		 66 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.117879 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1338  50S ribosomal protein L33  89.39 
 
 		 64 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1136  50S ribosomal protein L33  80.3 
 
 		 66 aa  103  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0863139  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1122  50S ribosomal protein L33  81.82 
 
 		 64 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.529669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3097  50S ribosomal protein L33  77.27 
 
 		 64 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5172  50S ribosomal protein L33  74.24 
 
 		 64 aa  99.4  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.566722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1320  50S ribosomal protein L33  74.24 
 
 		 64 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08941  50S ribosomal protein L33  74.24 
 
 		 65 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.330509  decreased coverage  0.000000158972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1688  50S ribosomal protein L33  74.24 
 
 		 64 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1670  50S ribosomal protein L33  74.24 
 
 		 64 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10121  50S ribosomal protein L33  74.24 
 
 		 65 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.146054  hitchhiker  0.000929045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3728  50S ribosomal protein L33  74.19 
 
 		 62 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0638325 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0339  50S ribosomal protein L33  72.73 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0383685  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1587  50S ribosomal protein L33  66.67 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.198749  hitchhiker  0.00724458 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0931  50S ribosomal protein L33  68.18 
 
 		 64 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.479255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09921  50S ribosomal protein L33  68.18 
 
 		 64 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09511  50S ribosomal protein L33  65.15 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0903  ribosomal protein L33  77.42 
 
 		 62 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.561223 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09901  50S ribosomal protein L33  67.86 
 
 		 55 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0571  hypothetical protein  51.52 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29405  predicted protein  44.62 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0687421  normal  0.212032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1183  50S ribosomal protein L33  50.82 
 
 		 54 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00129055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1554  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000411088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1349  50S ribosomal protein L33  51.52 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3522  ribosomal protein L33  51.52 
 
 		 60 aa  57  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13558  50S ribosomal protein L33  51.52 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1534  50S ribosomal protein L33  43.55 
 
 		 54 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298593  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1680  50S ribosomal protein L33  45.45 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4982  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1959  50S ribosomal protein L33  47.76 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3609  ribosomal protein L33  46.97 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2140  ribosomal protein L33  50 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00792155  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5352  ribosomal protein L33  46.97 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1500  50S ribosomal protein L33  50 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000133307  normal  0.765862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3088  ribosomal protein L33  46.97 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174245  normal  0.0267836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01020  ribosomal protein L33  46.67 
 
 		 55 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.1928e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0649  50S ribosomal protein L33  48.48 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0663  ribosomal protein L33  42.42 
 
 		 55 aa  50.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.023048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0287  50S ribosomal protein L33P  40.91 
 
 		 55 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0897  50S ribosomal protein L33  44.26 
 
 		 54 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.178264  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2689  ribosomal protein L33  45 
 
 		 54 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21410  LSU ribosomal protein L33P  41.54 
 
 		 56 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00000944878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2717  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00191424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2870  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0631761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1229  50S ribosomal protein L33  45.31 
 
 		 55 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5122  50S ribosomal protein L33  45.31 
 
 		 55 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1105  ribosomal protein L33  45.31 
 
 		 55 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.184146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0919  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 50 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1377  ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000000360963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3342  50S ribosomal protein L33  44.07 
 
 		 50 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145467 
 
 
-
 
NC_002936  DET0996  50S ribosomal protein L33  39.39 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000243211  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_868  ribosomal protein L33  39.39 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000132161  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0598  ribosomal protein L33  41.54 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.761553  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1542  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  normal  0.759054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6366  50S ribosomal protein L33  43.28 
 
 		 56 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1932  ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000219423  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0887  50S ribosomal protein L33  39.39 
 
 		 55 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000422402  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0239  ribosomal protein L33  40 
 
 		 56 aa  47.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2694  ribosomal protein L33  43.08 
 
 		 56 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2169  50S ribosomal protein L33P  38.33 
 
 		 49 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0020  ribosomal protein L33  40.62 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21200  LSU ribosomal protein L33P  40 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1320  ribosomal protein L33  36.67 
 
 		 54 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.440087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2727  ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.383463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0305  ribosomal protein L33  38.33 
 
 		 49 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000123978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1332  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00637997  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08660  LSU ribosomal protein L33P  38.33 
 
 		 49 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000650228  hitchhiker  0.0000000147794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1826  ribosomal protein L33  43.55 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10647  50S ribosomal protein L33  40.91 
 
 		 55 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0308205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2994  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 49 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0305  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000647748  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1177  ribosomal protein L33  36.67 
 
 		 49 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000979821  unclonable  0.0000000170129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0403  50S ribosomal protein L33  38.33 
 
 		 49 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.1461e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0521  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 52 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0668  50S ribosomal protein L33  40 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0319237  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0500  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 52 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100015  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1464  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 52 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000282952  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1671  50S ribosomal protein L33  43.94 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00190063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0208  ribosomal protein L33  40 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2385  ribosomal protein L33  40 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.60269  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0441  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 52 aa  45.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000206141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4346  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4168  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4490  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0917  50S ribosomal protein L33  42.19 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07670  LSU ribosomal protein L33P  40 
 
 		 56 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.041948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0737  ribosomal protein L33  40.62 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0934  50S ribosomal protein L33  42.19 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0200  50S ribosomal protein L33  36.67 
 
 		 49 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4119  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0178  LSU ribosomal protein L33P  40 
 
 		 49 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000816698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4399  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4380  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0854  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4286  50S ribosomal protein L33  41.67 
 
 		 49 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.664529 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0904  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 49 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0945  50S ribosomal protein L33  42.19 
 
 		 55 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1609  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 49 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.353079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1643  50S ribosomal protein L33  43.33 
 
 		 49 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.274003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4334  50S ribosomal protein L33  40.91 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>