More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10738 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10738  putative aminotransferase  100 
 
 
365 aa  756    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250686  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0714  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  65.36 
 
 
375 aa  501  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0334  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  58.84 
 
 
377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3387  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  53.39 
 
 
381 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  55.14 
 
 
372 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3253  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.59 
 
 
384 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5394  aminotransferase family protein  51.55 
 
 
371 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0821  hypothetical protein  50.14 
 
 
500 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0792  hypothetical protein  50.14 
 
 
500 aa  358  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2521  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.09 
 
 
369 aa  358  9e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2345  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50.28 
 
 
382 aa  349  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1573  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  47.8 
 
 
500 aa  349  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  48.32 
 
 
379 aa  347  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2633  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.68 
 
 
390 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152572  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3048  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  50.14 
 
 
382 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0361  aminotransferase-like  46.98 
 
 
383 aa  336  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0950  putative perosamine synthetase  48.03 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.251305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1355  perosamine synthetase, putative  48.75 
 
 
364 aa  323  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1969  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  47.49 
 
 
384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.886816  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0599  general glycosylation pathway protein  46.61 
 
 
386 aa  305  6e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0448  processing protease  47.5 
 
 
363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1213  cell wall biosynthesis enzyme  42.78 
 
 
368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.578129  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1139  general glycosylation pathway protein  46.35 
 
 
386 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.957255  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1264  general glycosylation pathway protein  46.35 
 
 
386 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.905092  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1203  putative perosamine synthetase  46.93 
 
 
363 aa  301  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1257  UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C4 aminotransferase  44.36 
 
 
386 aa  287  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.38 
 
 
368 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.78 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5255  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.62 
 
 
381 aa  258  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  39.18 
 
 
362 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.31 
 
 
402 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12432  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1974  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  35.03 
 
 
384 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.953061  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.91 
 
 
372 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  36.26 
 
 
367 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0563  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.98 
 
 
381 aa  236  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0047  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.98 
 
 
386 aa  236  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14101  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  38.42 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.44 
 
 
365 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0593  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.5 
 
 
383 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001802  putative aminotransferase DegT family  37.54 
 
 
383 aa  229  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00668  UDP-bacillosamine synthetase  36.64 
 
 
383 aa  228  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4084  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.36 
 
 
392 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  34.7 
 
 
367 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.46 
 
 
387 aa  227  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.62 
 
 
372 aa  225  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  37.81 
 
 
364 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0252  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.41 
 
 
381 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0171  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.41 
 
 
381 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5132  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.67 
 
 
380 aa  223  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2305  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  36.94 
 
 
383 aa  222  8e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2329  pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis  35.76 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  37.64 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.15 
 
 
371 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.14 
 
 
368 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.15 
 
 
371 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.6 
 
 
389 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0525  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.18 
 
 
395 aa  216  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12411  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  34.77 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.485468  hitchhiker  0.0071561 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3098  UDP-bacillosamine synthetase  36.23 
 
 
385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.33 
 
 
367 aa  212  9e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16970  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.6 
 
 
391 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0393  aminotransferase  38.14 
 
 
380 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2587  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.67 
 
 
383 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0384123  hitchhiker  0.000234634 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1514  aminotransferase  37.8 
 
 
381 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1586  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.71 
 
 
382 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.257863  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4213  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  33.8 
 
 
382 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.03 
 
 
372 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4504  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.63 
 
 
382 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0369  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.47 
 
 
389 aa  202  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2975  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.08 
 
 
391 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3119  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.08 
 
 
391 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.39 
 
 
370 aa  199  6e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.93 
 
 
507 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4223  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  34.33 
 
 
374 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1461  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.73 
 
 
399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.23 
 
 
384 aa  195  8.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3059  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.62 
 
 
370 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.88 
 
 
393 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0056  perosamine synthetase  34.29 
 
 
375 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0267366  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  30.14 
 
 
591 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0666  aminotransferase  30.51 
 
 
586 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  30.51 
 
 
591 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  30.51 
 
 
586 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.33 
 
 
394 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1998  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.56 
 
 
389 aa  189  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1720  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  35.49 
 
 
401 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.946093  hitchhiker  0.000000214942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.06 
 
 
371 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.87 
 
 
373 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0486  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.04 
 
 
403 aa  185  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3652  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.69 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2221  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.81 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01121  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  32.5 
 
 
395 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4858  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.04 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3206  UDP-4-keto-6-deoxy-N-acetylglucosamine 4-aminotransferase  34 
 
 
391 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.38 
 
 
366 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.85 
 
 
383 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.85 
 
 
383 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0874  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.24 
 
 
366 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1460  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.87 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.594691  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1361  glutamine--scyllo-inositol transaminase  29.74 
 
 
407 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>