More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03130 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1063  pyruvate kinase  68.84 
 
 		 488 aa  696    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.175798  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03130  pyruvate kinase  100 
 
 		 476 aa  987    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0435027  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1141  pyruvate kinase  71.28 
 
 		 477 aa  719    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4190  pyruvate kinase  51.16 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.85429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3378  pyruvate kinase  45.87 
 
 		 479 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2321  pyruvate kinase  43.95 
 
 		 496 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  46.6 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  43.04 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1420  hypothetical protein  43.29 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  43.78 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1400  pyruvate kinase  43.8 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  43.86 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  44.08 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  43.04 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  42.35 
 
 		 597 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  42.14 
 
 		 596 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  42.65 
 
 		 596 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  42.35 
 
 		 596 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  41.4 
 
 		 584 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  42.16 
 
 		 581 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  41.44 
 
 		 580 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  41.31 
 
 		 471 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  40.97 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  41.09 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  41.7 
 
 		 605 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 594 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  42 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  40.47 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  41.06 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  41.31 
 
 		 494 aa  369  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  42.07 
 
 		 588 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  42.14 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  42.41 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  41.42 
 
 		 585 aa  365  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  41.95 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  42.19 
 
 		 585 aa  364  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  40.71 
 
 		 601 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  40.25 
 
 		 592 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  40.25 
 
 		 592 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  39.83 
 
 		 472 aa  364  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  41.56 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  39.32 
 
 		 583 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  41.77 
 
 		 585 aa  362  9e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 578 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  41.18 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  40.25 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  41.18 
 
 		 472 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  40.25 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  42.11 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  40.26 
 
 		 589 aa  360  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  42.14 
 
 		 587 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  41.47 
 
 		 470 aa  359  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  39.87 
 
 		 472 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  41.46 
 
 		 471 aa  359  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  39.87 
 
 		 472 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  39.87 
 
 		 472 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  41.74 
 
 		 480 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  40.83 
 
 		 600 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  40.89 
 
 		 476 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  40.13 
 
 		 590 aa  357  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  40.79 
 
 		 474 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  39.92 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  40.81 
 
 		 582 aa  356  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  40.62 
 
 		 488 aa  356  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  42 
 
 		 480 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  40.55 
 
 		 580 aa  355  7.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 476 aa  355  8.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  41.18 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  40.68 
 
 		 482 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  38.49 
 
 		 474 aa  354  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  39.19 
 
 		 481 aa  353  5e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  40.47 
 
 		 482 aa  353  5e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 586 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  40.34 
 
 		 474 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  38.89 
 
 		 583 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  39.32 
 
 		 472 aa  351  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  41.25 
 
 		 470 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  40.33 
 
 		 474 aa  350  3e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001645  pyruvate kinase  44.21 
 
 		 470 aa  350  4e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000413201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  39.19 
 
 		 477 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  39.42 
 
 		 493 aa  349  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  39.19 
 
 		 472 aa  349  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  39.45 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00829  pyruvate kinase  43.38 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  38.54 
 
 		 487 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  40.08 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  39.7 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  39.75 
 
 		 489 aa  346  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  40.35 
 
 		 587 aa  346  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  38.53 
 
 		 474 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  40.89 
 
 		 478 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  39.96 
 
 		 478 aa  345  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  43.02 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>