21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3870 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3870  hypothetical protein  100 
 
 		 743 aa  1521    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0815  hypothetical protein  87.65 
 
 		 760 aa  1321    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2477  hypothetical protein  60.83 
 
 		 763 aa  888    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3875  hypothetical protein  50.5 
 
 		 659 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0810  hypothetical protein  50.5 
 
 		 658 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1200  hypothetical protein  49.28 
 
 		 640 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000043038  normal  0.447188 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5604  hypothetical protein  38.63 
 
 		 772 aa  502  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4500  hypothetical protein  38.26 
 
 		 748 aa  485  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  26.37 
 
 		 1276 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2851  hypothetical protein  51.79 
 
 		 765 aa  67  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.215576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  51.79 
 
 		 524 aa  63.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  43.28 
 
 		 430 aa  60.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  25 
 
 		 1086 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  39.13 
 
 		 1107 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5274  alpha-L-rhamnosidase  46.3 
 
 		 897 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.340357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  37.68 
 
 		 818 aa  51.6  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3739  hypothetical protein  47.17 
 
 		 128 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2219  hypothetical protein  40.74 
 
 		 184 aa  48.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  22.22 
 
 		 1141 aa  47.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  24.93 
 
 		 873 aa  47  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.29 
 
 		 1500 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>