More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2503 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  100 
 
 
399 aa  775    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  75.06 
 
 
400 aa  531  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  68.67 
 
 
398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  68.54 
 
 
397 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  65.82 
 
 
394 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  68.75 
 
 
390 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  66.92 
 
 
401 aa  484  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  66.24 
 
 
396 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  69.07 
 
 
390 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  64.21 
 
 
392 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  69.67 
 
 
401 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  64.21 
 
 
392 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  66.67 
 
 
396 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  69.62 
 
 
390 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  66.67 
 
 
396 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  66.41 
 
 
396 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  69.79 
 
 
401 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  66.93 
 
 
390 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  63.35 
 
 
385 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  66.93 
 
 
390 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  62.05 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  66.67 
 
 
390 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  61.64 
 
 
382 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  56.92 
 
 
395 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.16 
 
 
392 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  70 
 
 
188 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  70 
 
 
188 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  68.75 
 
 
187 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  68.75 
 
 
187 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.85 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  33.86 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.07 
 
 
379 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.6 
 
 
404 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  31.94 
 
 
382 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  32.43 
 
 
393 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.93 
 
 
387 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.17 
 
 
389 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.78 
 
 
387 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  30.58 
 
 
376 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  31.35 
 
 
379 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.97 
 
 
386 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  31.97 
 
 
376 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  34.07 
 
 
388 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.92 
 
 
391 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  28.99 
 
 
376 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  28.19 
 
 
442 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.64 
 
 
450 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.14 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  27.63 
 
 
444 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  28.61 
 
 
408 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  28.46 
 
 
446 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  27.68 
 
 
456 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  28.19 
 
 
408 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  28.57 
 
 
443 aa  142  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  29.63 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  28.18 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  27.33 
 
 
456 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.51 
 
 
395 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  28.19 
 
 
428 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  32.03 
 
 
378 aa  136  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  29.66 
 
 
428 aa  136  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  28.35 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  29.07 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  26.11 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.46 
 
 
420 aa  132  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.54 
 
 
457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  26.87 
 
 
467 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  30.95 
 
 
417 aa  130  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  26.72 
 
 
416 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  27.39 
 
 
450 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  24.42 
 
 
463 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.09 
 
 
467 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.76 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.57 
 
 
469 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  25.8 
 
 
483 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  24.86 
 
 
462 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  29.06 
 
 
452 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.65 
 
 
469 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.81 
 
 
441 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.24 
 
 
441 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  28.61 
 
 
449 aa  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  24.81 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  29.22 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  28.24 
 
 
460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  29.25 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.84 
 
 
470 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  30.51 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1609  chromate transporter  32.57 
 
 
398 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79904  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  29.5 
 
 
383 aa  113  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.98 
 
 
386 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.77 
 
 
473 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  23.44 
 
 
461 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  27.18 
 
 
383 aa  109  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  27.81 
 
 
393 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  28.03 
 
 
409 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  32.86 
 
 
455 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  26.59 
 
 
432 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  27.17 
 
 
431 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  27.55 
 
 
393 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  28.43 
 
 
411 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>