77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4093 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4093  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  191  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  85.57 
 
 		 97 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0417  hypothetical protein  82.47 
 
 		 97 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  61.05 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  53.61 
 
 		 97 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2189  protein of unknown function DUF1330  52.08 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  49.48 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4724  hypothetical protein  47.42 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3616  hypothetical protein  48.45 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2987  protein of unknown function DUF1330  48.96 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  44.21 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  40.43 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  41.49 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  42.27 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  43.18 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  38.95 
 
 		 114 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  43.3 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  43.3 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  40 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  40.86 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  45.45 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  39.58 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  38.95 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  37.89 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  34.02 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  35.79 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  41.24 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  36.84 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  40 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  35.24 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  38.54 
 
 		 97 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  35.05 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  34.74 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  41.24 
 
 		 97 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  35.79 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  38.3 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1800  protein of unknown function DUF1330  37.89 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472957  normal  0.250055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1521  hypothetical protein  37.89 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  0.585973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  34.02 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  36.63 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  37.23 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  35.79 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  38.36 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  39.58 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2998  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  34.74 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  38.2 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  38.54 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  37.11 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  36.05 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  37.18 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  37.89 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  34.38 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  35.05 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  31.96 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  31.63 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  32 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  37.65 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  32.65 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  34.94 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1498  hypothetical protein  37.8 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  34.38 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  38.1 
 
 		 102 aa  40.8  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  32.29 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  32.69 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>