35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2987 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2987  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 		 98 aa  192  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4724  hypothetical protein  75.51 
 
 		 97 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  72.45 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  72.45 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3616  hypothetical protein  72.45 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  53.61 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2189  protein of unknown function DUF1330  54.17 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321653  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  47.92 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4093  hypothetical protein  48.96 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0417  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  42.5 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  39.18 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  35.79 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  35.79 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  38.54 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  36.73 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2998  hypothetical protein  52.54 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  36.46 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  37.89 
 
 		 95 aa  47.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  34.69 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  34.29 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  36.19 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  36.08 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  32.38 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  35.05 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  33.64 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  34.04 
 
 		 97 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  30.69 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  36.78 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  30.93 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  38.75 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  35.24 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  34.44 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>