More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3290 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  73.49 
 
 
516 aa  779    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  76.88 
 
 
517 aa  820    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  76.88 
 
 
522 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  73.37 
 
 
511 aa  782    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  75.59 
 
 
517 aa  810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  75.24 
 
 
515 aa  821    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  73.44 
 
 
516 aa  777    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  100 
 
 
513 aa  1062    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  73.63 
 
 
516 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  73.37 
 
 
511 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  73.44 
 
 
516 aa  777    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  76.88 
 
 
522 aa  821    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  73.57 
 
 
511 aa  775    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  76.88 
 
 
522 aa  821    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  76.88 
 
 
522 aa  821    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  76.68 
 
 
517 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  76.88 
 
 
522 aa  821    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  75.05 
 
 
512 aa  812    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  61.46 
 
 
518 aa  640    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  59.8 
 
 
505 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  59.41 
 
 
505 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  58.93 
 
 
501 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  59.41 
 
 
505 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  58.33 
 
 
501 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  60.24 
 
 
503 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  57.94 
 
 
510 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  59.21 
 
 
505 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  59.45 
 
 
503 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  57.4 
 
 
502 aa  591  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  54.47 
 
 
509 aa  549  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  47.63 
 
 
501 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  47.43 
 
 
501 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  53.26 
 
 
594 aa  455  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  47.14 
 
 
504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  46.75 
 
 
502 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  47.63 
 
 
502 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  47.63 
 
 
501 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  48.92 
 
 
520 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  48.74 
 
 
496 aa  445  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  47.13 
 
 
498 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  45.83 
 
 
502 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  46.08 
 
 
512 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  45.06 
 
 
504 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  45.76 
 
 
503 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  33.05 
 
 
489 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  31.31 
 
 
482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  31.32 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  31.95 
 
 
496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  30.19 
 
 
476 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  28.48 
 
 
586 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  27.94 
 
 
523 aa  166  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  28.98 
 
 
493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  29.7 
 
 
511 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  30.8 
 
 
535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  27.4 
 
 
535 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  29.4 
 
 
474 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  28.63 
 
 
473 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  27.84 
 
 
526 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  30.27 
 
 
565 aa  159  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  30.3 
 
 
487 aa  159  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  27.9 
 
 
499 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  26.78 
 
 
458 aa  156  8e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  30.21 
 
 
478 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  29.9 
 
 
572 aa  153  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  31.72 
 
 
497 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  25.58 
 
 
491 aa  151  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  28.75 
 
 
483 aa  151  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  28.93 
 
 
549 aa  150  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  29.28 
 
 
497 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  25.49 
 
 
480 aa  150  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  28.22 
 
 
499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  30.65 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  27.53 
 
 
502 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  27.27 
 
 
537 aa  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  26.17 
 
 
497 aa  147  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  27.96 
 
 
554 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  27.49 
 
 
481 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  28.93 
 
 
508 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.94 
 
 
497 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  29.46 
 
 
479 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.32 
 
 
486 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  29.37 
 
 
536 aa  143  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.03 
 
 
497 aa  143  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  28.06 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  26.93 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  26.68 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  28.63 
 
 
494 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  26.45 
 
 
497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  26.45 
 
 
497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  26.45 
 
 
497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  27.05 
 
 
514 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  28.98 
 
 
517 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  28.66 
 
 
505 aa  140  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  28.46 
 
 
498 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  27.96 
 
 
523 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  30.56 
 
 
497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.19 
 
 
501 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.48 
 
 
497 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.48 
 
 
497 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.48 
 
 
497 aa  136  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>