More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0605 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
278 aa  547  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  81.65 
 
 
278 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  83.09 
 
 
278 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  76.17 
 
 
276 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  76.17 
 
 
276 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  76.17 
 
 
276 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75.81 
 
 
276 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75.09 
 
 
276 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75.45 
 
 
276 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  74.73 
 
 
276 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2038  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75 
 
 
276 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3092  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75 
 
 
276 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2575  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75 
 
 
276 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2168  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75 
 
 
276 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3120  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75 
 
 
276 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1512  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75 
 
 
276 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13116  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0742  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75 
 
 
276 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3057  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  75 
 
 
276 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.51 
 
 
293 aa  350  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.48 
 
 
293 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.11 
 
 
293 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.11 
 
 
293 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.48 
 
 
293 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.14 
 
 
281 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.72 
 
 
303 aa  329  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  58.27 
 
 
274 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.32 
 
 
274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.55 
 
 
274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.6 
 
 
277 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.83 
 
 
274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.55 
 
 
274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.4 
 
 
277 aa  305  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.76 
 
 
273 aa  305  7e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.43 
 
 
277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.76 
 
 
274 aa  302  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.51 
 
 
275 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.88 
 
 
270 aa  298  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  57.82 
 
 
273 aa  293  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1046  undecaprenyl-diphosphatase  54.74 
 
 
285 aa  291  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.500366  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.88 
 
 
276 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  52.88 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  51.13 
 
 
269 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.99 
 
 
276 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.44 
 
 
274 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.81 
 
 
277 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.8 
 
 
274 aa  275  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.62 
 
 
276 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.38 
 
 
276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.88 
 
 
277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.9 
 
 
276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  53.41 
 
 
267 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.26 
 
 
277 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.88 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.54 
 
 
277 aa  265  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  53.96 
 
 
266 aa  265  7e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.9 
 
 
276 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  50.91 
 
 
276 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.25 
 
 
267 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  47.89 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.06 
 
 
266 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0223  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.42 
 
 
268 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.56 
 
 
268 aa  215  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0491  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.39 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  46.72 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000318908  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.48 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1339  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.23 
 
 
268 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2777  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.31 
 
 
268 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1807  putative undecaprenol kinase  46.46 
 
 
305 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.38 
 
 
268 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0981  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.38 
 
 
268 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0661  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.13 
 
 
268 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.171076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.13 
 
 
268 aa  208  9e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3134  undecaprenol kinase  44.36 
 
 
267 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112923  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.72 
 
 
273 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  46.72 
 
 
273 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.72 
 
 
273 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.72 
 
 
273 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.72 
 
 
273 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  46.72 
 
 
273 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3561  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
273 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0840276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3391  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
273 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000584329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
273 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.184869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3395  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
273 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  44.44 
 
 
267 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3465  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
273 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
270 aa  206  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
273 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
273 aa  206  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  43.82 
 
 
286 aa  205  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2387  undecaprenol kinase  43.62 
 
 
283 aa  205  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371551  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 
268 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2664  undecaprenol kinase  43.62 
 
 
283 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.51 
 
 
272 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.89 
 
 
268 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5002  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.92 
 
 
265 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0215  undecaprenol kinase  44.02 
 
 
267 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086247  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.79 
 
 
273 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  46.4 
 
 
274 aa  202  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.22 
 
 
278 aa  203  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.38 
 
 
265 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.14248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>