More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0459 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0459  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
263 aa  524  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000279105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2647  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.68 
 
 
266 aa  187  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2969  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.68 
 
 
266 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3151  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.84 
 
 
265 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.232227  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.6 
 
 
274 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.15 
 
 
263 aa  178  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0303  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.54 
 
 
269 aa  175  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.54 
 
 
269 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.54 
 
 
269 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.54 
 
 
269 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.54 
 
 
269 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.54 
 
 
269 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  40.15 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0416  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 
269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
272 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
272 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.88 
 
 
264 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.4 
 
 
272 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
272 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 
269 aa  168  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.02 
 
 
272 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
272 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
272 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.17 
 
 
272 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.77 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.85 
 
 
272 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.17 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.84 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
270 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.15 
 
 
269 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
272 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
272 aa  155  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.76 
 
 
276 aa  155  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.83 
 
 
275 aa  155  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4459  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.11 
 
 
267 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
276 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.07 
 
 
267 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.55 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.96 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.96 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.4 
 
 
260 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.55 
 
 
274 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
275 aa  152  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.17 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.72 
 
 
264 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.01 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
266 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.7 
 
 
269 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.84 
 
 
270 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.08 
 
 
271 aa  149  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.82 
 
 
273 aa  148  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_13156  predicted protein  36.4 
 
 
276 aa  148  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.37833  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.21 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00740  pyrroline-5-carboxylate reductase, putative  34.36 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  33.74 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.08 
 
 
272 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.35 
 
 
270 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.44 
 
 
282 aa  146  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.33 
 
 
271 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1990  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
268 aa  145  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307416  normal  0.0845217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.64 
 
 
276 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.96 
 
 
270 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2788  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.21 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.510272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1440  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.81 
 
 
267 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000312208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2914  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.29 
 
 
265 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2285  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
266 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.95 
 
 
275 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25379  predicted protein  32.96 
 
 
289 aa  142  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0647  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.94 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.381317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0968  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.15 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0668  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.36 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.810175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3266  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.38 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.674816  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3146  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.73 
 
 
277 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.44 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.01 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.57 
 
 
267 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2835  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.46 
 
 
279 aa  138  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3496  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.56 
 
 
272 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231373  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.69 
 
 
262 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.68 
 
 
272 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.71 
 
 
281 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.44 
 
 
271 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02750  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.23 
 
 
270 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0863  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.04 
 
 
267 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2165  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.89 
 
 
269 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.94 
 
 
271 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.18 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3161  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.48 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00631355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>