More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5195 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5195  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
306 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2782  LysR family transcriptional regulator  95.1 
 
 
341 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4643  LysR family transcriptional regulator  56.08 
 
 
303 aa  351  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5172  LysR family transcriptional regulator  56.08 
 
 
303 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3437  LysR family transcriptional regulator  56.08 
 
 
304 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0367  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 
305 aa  348  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968869  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5283  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
305 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.770818  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4985  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
305 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3084  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
305 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0785  LysR family transcriptional regulator  55.41 
 
 
304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.352567  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0638  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
304 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.327526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1596  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
304 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1997  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
304 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0675  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
304 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2155  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
304 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2242  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 
304 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0637  LysR family transcriptional regulator  52.56 
 
 
304 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3439  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
306 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1040  transcriptional regulator, LysR family  50.99 
 
 
306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0665507  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2149  transcriptional regulator, LysR family  53.14 
 
 
298 aa  316  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.463348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2060  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5120  LysR family transcriptional regulator  51.88 
 
 
297 aa  312  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2553  transcriptional regulator, LysR family  50.78 
 
 
302 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.36259  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1618  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
305 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0301028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3191  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
297 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49590  transcriptional regulator  40.88 
 
 
300 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224866  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3917  transcriptional regulator  41.4 
 
 
297 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46060  transcriptional regulator  41.4 
 
 
297 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.89621 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4054  LysR family transcriptional regulator  44.7 
 
 
298 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2574  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
320 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.475396  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4378  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
305 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840859  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1458  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3814  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4522  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1389  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4028  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  0.0962956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1818  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
296 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1799  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
299 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0309251  normal  0.330495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0380  transcriptional regulator  37.75 
 
 
316 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3104  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459931  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6363  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 
304 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284625  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5706  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
298 aa  185  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0443967  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2194  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
296 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0690526  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03780  putative transcriptional regulator  36.09 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3543  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
318 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0684  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
306 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743111  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1630  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.48911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0773  transcriptional regulator, LysR family  31.97 
 
 
306 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0677  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.65 
 
 
306 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0209  putative transcriptional regulator  31.51 
 
 
305 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.150203  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1551  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
306 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01640  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
305 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262408  normal  0.919946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4568  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00026007  normal  0.0106541 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4285  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0640  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
305 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148889  hitchhiker  0.000410503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4202  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0903744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3696  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0635  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210235  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0595  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.872616  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1659  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1579  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 
315 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3728  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3205  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
316 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241885  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4295  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
345 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6273  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.95 
 
 
301 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2317  LysR family regulatory protein  36.46 
 
 
302 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1095  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
316 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4054  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
316 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1699  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
341 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761604  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1381  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
316 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.727507  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1008  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
316 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0155  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
316 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150061  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0495  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
316 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4743  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
334 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1455  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
316 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3454  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 
314 aa  159  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2851  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 
321 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4038  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
331 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4102  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
312 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4312  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0100  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
306 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1124  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
318 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0608  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
309 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0374  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
317 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6019  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 
322 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4053  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.9 
 
 
311 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4436  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
352 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00650478  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3519  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3663  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
302 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0035  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
312 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3174  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 
320 aa  135  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1724  transcriptional regulator, LysR family  26.96 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4499  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
303 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1887  transcriptional regulator of LysR family protein  27.36 
 
 
308 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  0.0439695 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2197  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 
309 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3930  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
314 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4666  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3864  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.163001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1992  transcriptional regulator, LysR family  24.75 
 
 
313 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1540  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>