43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1259 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1259  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  344  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00906465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1137  Protein of unknown function DUF1790  68.67 
 
 
166 aa  248  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1376  Protein of unknown function DUF1790  61.01 
 
 
167 aa  218  4e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0854  hypothetical protein  59.12 
 
 
167 aa  216  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4947  hypothetical protein  60.13 
 
 
169 aa  212  2e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399738  hitchhiker  1.53474e-07 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4064  Protein of unknown function DUF1790  55.06 
 
 
168 aa  200  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3770  hypothetical protein  55.06 
 
 
168 aa  200  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4025  Protein of unknown function DUF1790  54.43 
 
 
168 aa  199  1e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.351333 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1475  hypothetical protein  51.2 
 
 
243 aa  189  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1525  hypothetical protein  51.2 
 
 
220 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1641  hypothetical protein  51.2 
 
 
166 aa  188  3e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2148  hypothetical protein  51.2 
 
 
166 aa  188  3e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.8454  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1407  hypothetical protein  52.2 
 
 
166 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.246502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3881  hypothetical protein  51.95 
 
 
179 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.832488  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1744  hypothetical protein  48.19 
 
 
166 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4848  Protein of unknown function DUF1790  49.69 
 
 
166 aa  182  1e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4170  hypothetical protein  47.59 
 
 
166 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2546  hypothetical protein  50 
 
 
166 aa  181  5e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2756  Protein of unknown function DUF1790  46.39 
 
 
166 aa  180  9e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3019  Protein of unknown function DUF1790  46.39 
 
 
166 aa  180  9e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2513  hypothetical protein  50.62 
 
 
166 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2250  hypothetical protein  46.99 
 
 
166 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338275  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3169  hypothetical protein  44.58 
 
 
166 aa  173  1e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3105  hypothetical protein  50.6 
 
 
179 aa  172  2e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2264  hypothetical protein  50 
 
 
167 aa  171  3e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3280  hypothetical protein  44.72 
 
 
166 aa  167  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0991  hypothetical protein  43.98 
 
 
166 aa  164  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0359037  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1096  Protein of unknown function DUF1790  38.22 
 
 
167 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.820328  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2703  hypothetical protein  39.63 
 
 
167 aa  137  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.600419  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0763  hypothetical protein  40.52 
 
 
167 aa  127  8e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.396097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1141  hypothetical protein  37.13 
 
 
167 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0622  hypothetical protein  33.13 
 
 
166 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4471  hypothetical protein  35.9 
 
 
170 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.39855  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1322  hypothetical protein  35.06 
 
 
167 aa  116  1e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19423  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2646  hypothetical protein  35.06 
 
 
176 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3008  hypothetical protein  35.06 
 
 
167 aa  114  4e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719619  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2199  hypothetical protein  33.12 
 
 
166 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00724399  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3363  hypothetical protein  35.06 
 
 
173 aa  114  7e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3330  hypothetical protein  33.77 
 
 
167 aa  113  1e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.635014  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0039  hypothetical protein  33.55 
 
 
152 aa  110  8e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158376  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0676  hypothetical protein  31.37 
 
 
168 aa  107  9e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3255  hypothetical protein  29.01 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0701128  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0545  hypothetical protein  28.32 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>