145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0410 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0410  globin  100 
 
 
144 aa  299  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  63.57 
 
 
152 aa  180  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  60 
 
 
141 aa  174  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  63.49 
 
 
144 aa  173  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  57.89 
 
 
139 aa  153  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  54.2 
 
 
137 aa  152  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  55.2 
 
 
142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  49.61 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  46.92 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  47.54 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  46.4 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  43.75 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  44.53 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  44.88 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  41.6 
 
 
129 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  45.16 
 
 
129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  45.97 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  42.86 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  43.94 
 
 
136 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  43.41 
 
 
130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  46.22 
 
 
142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  43.94 
 
 
137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  44.63 
 
 
139 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  45.97 
 
 
136 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  45.97 
 
 
136 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  45.97 
 
 
136 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  45.97 
 
 
136 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  45.16 
 
 
148 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  44.35 
 
 
136 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  45.16 
 
 
148 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  45.16 
 
 
136 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  45.16 
 
 
136 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  45.16 
 
 
136 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  45.16 
 
 
136 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  45.16 
 
 
136 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  38.35 
 
 
145 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  45.16 
 
 
136 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  47.2 
 
 
141 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  47.2 
 
 
141 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  45.16 
 
 
136 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  43.09 
 
 
134 aa  104  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  45.67 
 
 
143 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  38.71 
 
 
145 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  43.94 
 
 
137 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  45.31 
 
 
133 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  38.35 
 
 
145 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  39.34 
 
 
145 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  38.35 
 
 
145 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  43.85 
 
 
166 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  41.32 
 
 
131 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  37.88 
 
 
144 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  45.38 
 
 
128 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  40.8 
 
 
147 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  43.55 
 
 
130 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  40.94 
 
 
142 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  43.55 
 
 
129 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  38.52 
 
 
144 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  36.23 
 
 
145 aa  100  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  41.3 
 
 
150 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  36.96 
 
 
145 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  36.23 
 
 
145 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  40.8 
 
 
136 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  44.63 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  40.16 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  36.29 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  43.44 
 
 
126 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  41.41 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3074  globin  37.1 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0236905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  36.89 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  40.16 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  39.2 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  42.28 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  40.6 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  42.74 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  42.24 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1541  hypothetical protein  41.74 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  42.16 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  40.32 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  35.56 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  37.69 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  38.81 
 
 
132 aa  89  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  38.76 
 
 
127 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  38.52 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  40.52 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  37.4 
 
 
137 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  40.32 
 
 
125 aa  87.8  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  40.82 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  40.82 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  42.72 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  42.72 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  42.72 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  43.24 
 
 
128 aa  87  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  38.28 
 
 
135 aa  87  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  36.36 
 
 
132 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  40.82 
 
 
132 aa  86.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  40.82 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  40.82 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  40.82 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  40.82 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  39.84 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>