33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00600 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  891    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  41.19 
 
 
491 aa  259  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  37.77 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  46.42 
 
 
457 aa  252  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  40.72 
 
 
502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  33.63 
 
 
439 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  33.41 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  34.46 
 
 
438 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  33.11 
 
 
441 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  36.22 
 
 
449 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  34.98 
 
 
439 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  33.7 
 
 
440 aa  202  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  29.63 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  32.23 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  29.41 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  37.3 
 
 
444 aa  195  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  34.91 
 
 
445 aa  187  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  34.91 
 
 
445 aa  187  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  30.07 
 
 
457 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  33.12 
 
 
480 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  27.81 
 
 
449 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  32.98 
 
 
448 aa  170  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  27.83 
 
 
450 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  26.75 
 
 
449 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  26.71 
 
 
449 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  32.28 
 
 
448 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  28.91 
 
 
437 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  34.68 
 
 
411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2153  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  26.99 
 
 
572 aa  50.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.819052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0750  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.66 
 
 
572 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0986  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  25.22 
 
 
572 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  30.05 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  25.53 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>