63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2186 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  100 
 
 
223 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  36.74 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  35.81 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  35.65 
 
 
223 aa  161  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  35.65 
 
 
221 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  35.65 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  35.19 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  35.35 
 
 
223 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  35.35 
 
 
223 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  36.82 
 
 
230 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  37.09 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  38.25 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  37.9 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  34.88 
 
 
250 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  37.95 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  39.49 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  33.78 
 
 
248 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  34.97 
 
 
164 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  35.23 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  27.08 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  26.32 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  26.56 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  26.56 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  24.08 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  26.84 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  27.37 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3008  uridine kinase  27.23 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  23.04 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  29.67 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  25.4 
 
 
191 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  23.91 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  23.81 
 
 
189 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  23.85 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2748  uridine kinase  26.32 
 
 
193 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942955  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  19.61 
 
 
231 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0965  putative uridine kinase  29.32 
 
 
204 aa  52  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.807894  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  19.61 
 
 
231 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  27.4 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3589  putative uridine kinase  31.38 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2482  uridine kinase  30.43 
 
 
211 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0317  pantothenate kinase  30.89 
 
 
318 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0977  phosphoribulokinase  26.04 
 
 
333 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.000000000000194465  normal  0.0613033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3621  uridine kinase  23.08 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  29.93 
 
 
530 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  24.74 
 
 
316 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4240  phosphoribulokinase  26.11 
 
 
334 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000329747  hitchhiker  0.0000174575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  29.25 
 
 
105 aa  45.1  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1332  phosphoribulokinase/uridine kinase  25.37 
 
 
321 aa  44.3  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0294  pantothenate kinase  33.71 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1896  pantothenate kinase  33.71 
 
 
318 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0781  phosphoribulokinase  25.29 
 
 
334 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000028784  unclonable  0.0000000817454 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0951  pantothenate kinase  23.84 
 
 
306 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0633227  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  22.44 
 
 
504 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0011  uridine kinase  27.45 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  25.58 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07150  uridine kinase  25.64 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0409  pantothenate kinase  30 
 
 
318 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01170  pantothenate kinase  30.22 
 
 
310 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0312  pantothenate kinase  29.3 
 
 
317 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  31.82 
 
 
216 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0411  pantothenate kinase  30 
 
 
318 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  28.77 
 
 
229 aa  41.6  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1781  uridine kinase  26.09 
 
 
209 aa  41.6  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>