35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0748 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  100 
 
 		 447 aa  924    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  49.78 
 
 		 785 aa  228  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  43.55 
 
 		 342 aa  227  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  41.62 
 
 		 1644 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  41.62 
 
 		 1644 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  47.32 
 
 		 477 aa  209  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  47.35 
 
 		 879 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  48.67 
 
 		 243 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  39.82 
 
 		 456 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  46.46 
 
 		 271 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  39.93 
 
 		 320 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  47.06 
 
 		 265 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  40.06 
 
 		 459 aa  203  6e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  43.17 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  43.01 
 
 		 314 aa  196  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  44.89 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  42.48 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  42.48 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  32 
 
 		 219 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  33.73 
 
 		 231 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  29.21 
 
 		 254 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  30.59 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2368  hypothetical protein  40.85 
 
 		 249 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  28.31 
 
 		 278 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  28.31 
 
 		 278 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  28.24 
 
 		 234 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  22.29 
 
 		 264 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  27.03 
 
 		 238 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  26.06 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  28.33 
 
 		 784 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  28.25 
 
 		 569 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  22.39 
 
 		 322 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  28.86 
 
 		 306 aa  46.6  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11547  hypothetical protein  27.46 
 
 		 243 aa  43.5  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1444 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>