70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5041 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2011  putative lipoprotein  84.16 
 
 		 417 aa  687    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3169  putative lipoprotein  83.21 
 
 		 417 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17692  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3132  putative lipoprotein  83.21 
 
 		 417 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2733  putative lipoprotein  84.16 
 
 		 417 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1876  putative lipoprotein  84.16 
 
 		 417 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0900  putative lipoprotein  84.16 
 
 		 417 aa  687    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5104  hypothetical protein  95.44 
 
 		 417 aa  803    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5177  hypothetical protein  95.68 
 
 		 417 aa  805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4516  hypothetical protein  98.08 
 
 		 417 aa  822    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3264  hypothetical protein  95.44 
 
 		 417 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5041  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  840    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1432  putative lipoprotein  82.25 
 
 		 417 aa  694    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0545  hypothetical protein  94 
 
 		 417 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.860048 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3186  putative lipoprotein  84.16 
 
 		 467 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0219261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2024  putative lipoprotein  72.79 
 
 		 419 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0718316  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2418  putative lipoprotein  72.79 
 
 		 419 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.77944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3682  putative lipoprotein  61.1 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000177686  unclonable  0.0000000000000176343 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3411  hypothetical protein  61.48 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238547  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0274  putative lipoprotein  60.35 
 
 		 414 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383725  unclonable  0.000000893699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3796  putative lipoprotein  58.87 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000651588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3857  putative lipoprotein  58.87 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00112042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0025  putative lipoprotein  58.87 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000955667  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2794  hypothetical protein  59.95 
 
 		 403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000181231  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0231  hypothetical protein  60.2 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000154041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0239  hypothetical protein  59.95 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000412577  hitchhiker  0.000000000983728 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0312  hypothetical protein  60.2 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000324654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1963  putative lipoprotein  58.63 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0292  hypothetical protein  60.2 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00023062  unclonable  0.0000000000623109 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0215  hypothetical protein  59.17 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000119575  unclonable  0.0000000000118774 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3130  putative lipoprotein  58.63 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3526  putative lipoprotein  58.63 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3517  putative lipoprotein  58.63 
 
 		 416 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3116  putative lipoprotein  57.92 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00639042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3592  hypothetical protein  55.95 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3444  putative lipoprotein  55.81 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3593  hypothetical protein  38.11 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3445  putative lipoprotein  39.71 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3412  hypothetical protein  34.75 
 
 		 473 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000300706  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2793  hypothetical protein  33.98 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0183447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0313  hypothetical protein  33.98 
 
 		 473 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0293  hypothetical protein  33.98 
 
 		 473 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0932383  unclonable  0.0000000000716846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2419  hypothetical protein  35.02 
 
 		 531 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0544  hypothetical protein  33.79 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1431  hypothetical protein  34.35 
 
 		 532 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2025  hypothetical protein  34.44 
 
 		 531 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.545482  normal  0.939283 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0232  hypothetical protein  34.68 
 
 		 477 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5042  hypothetical protein  33.2 
 
 		 532 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4517  hypothetical protein  32.41 
 
 		 532 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0240  hypothetical protein  34.2 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0335347  hitchhiker  0.0000000148251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0216  hypothetical protein  32.83 
 
 		 477 aa  193  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0142102  unclonable  0.0000000000138018 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3518  hypothetical protein  31.93 
 
 		 459 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3795  hypothetical protein  31.93 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000690611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0024  putative lipoprotein  31.93 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00801483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2591  hypothetical protein  31.93 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3129  hypothetical protein  31.93 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3527  hypothetical protein  31.93 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1964  hypothetical protein  31.93 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660445  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3856  hypothetical protein  31.93 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.737102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1877  hypothetical protein  39.64 
 
 		 532 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0899  hypothetical protein  39.35 
 
 		 532 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2732  hypothetical protein  39.35 
 
 		 532 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3170  hypothetical protein  39.35 
 
 		 532 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3188  putative lipoprotein  39.35 
 
 		 532 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3133  hypothetical protein  39.35 
 
 		 532 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3115  hypothetical protein  32.66 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00741759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0275  putative lipoprotein  29.65 
 
 		 477 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.108025  unclonable  0.00000113662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3263  hypothetical protein  36.42 
 
 		 532 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5105  hypothetical protein  36.42 
 
 		 532 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5176  hypothetical protein  36.13 
 
 		 532 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373205  normal  0.653676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3681  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 476 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00175926  hitchhiker  0.000000000000679861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>