More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0482 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  100 
 
 
154 aa  314  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  100 
 
 
154 aa  314  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  91.56 
 
 
154 aa  293  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  84.03 
 
 
162 aa  257  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  77.27 
 
 
153 aa  246  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  81.25 
 
 
151 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  80.56 
 
 
151 aa  244  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  76.19 
 
 
154 aa  237  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  71.43 
 
 
151 aa  226  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  76.43 
 
 
154 aa  225  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  69.74 
 
 
157 aa  218  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  5.90654e-07 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  68.71 
 
 
155 aa  217  5e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  69.66 
 
 
150 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  69.01 
 
 
153 aa  216  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  72.99 
 
 
161 aa  214  3e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  68.87 
 
 
155 aa  212  1e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  69.72 
 
 
153 aa  212  2e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  71.22 
 
 
155 aa  211  2e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  68.46 
 
 
157 aa  211  3e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  68.46 
 
 
151 aa  209  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  70 
 
 
154 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  70.71 
 
 
151 aa  208  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  67.79 
 
 
175 aa  207  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  67.79 
 
 
151 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  69.29 
 
 
145 aa  206  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.68272e-07  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  66.43 
 
 
145 aa  204  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  67.88 
 
 
166 aa  202  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  67.11 
 
 
157 aa  202  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  67.14 
 
 
150 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  69.5 
 
 
149 aa  201  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  66.44 
 
 
148 aa  201  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  66.44 
 
 
146 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  65.75 
 
 
148 aa  199  1e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  65.75 
 
 
148 aa  199  1e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  65.75 
 
 
148 aa  199  1e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  65.75 
 
 
148 aa  199  1e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  65.75 
 
 
148 aa  199  1e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  63.83 
 
 
143 aa  199  1e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  65.75 
 
 
148 aa  199  1e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  65.73 
 
 
155 aa  198  2e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  65.73 
 
 
155 aa  198  2e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  65.73 
 
 
155 aa  198  2e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  65.73 
 
 
155 aa  198  2e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  65.73 
 
 
155 aa  198  2e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  65.73 
 
 
155 aa  198  2e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  65.73 
 
 
155 aa  198  2e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  65.73 
 
 
155 aa  198  2e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  65.73 
 
 
155 aa  198  2e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  65.71 
 
 
149 aa  197  4e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  63.12 
 
 
143 aa  197  4e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  63.83 
 
 
156 aa  197  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  63.38 
 
 
150 aa  196  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  66.43 
 
 
147 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  66.43 
 
 
147 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  66.43 
 
 
147 aa  196  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  63.12 
 
 
173 aa  196  1e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  1.49307e-05  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  65.71 
 
 
148 aa  196  1e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  66.43 
 
 
147 aa  196  1e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.65419e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  65.03 
 
 
155 aa  195  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  65.03 
 
 
155 aa  195  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  65.03 
 
 
155 aa  195  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  65.03 
 
 
155 aa  195  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  63.19 
 
 
147 aa  195  2e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  65.03 
 
 
155 aa  195  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  66.43 
 
 
147 aa  194  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  61.97 
 
 
153 aa  194  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  62.59 
 
 
152 aa  194  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  63.7 
 
 
151 aa  194  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  66.43 
 
 
147 aa  194  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  66.67 
 
 
148 aa  194  4e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  63.77 
 
 
154 aa  194  5e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  63.77 
 
 
154 aa  194  5e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  63.77 
 
 
154 aa  194  5e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  68.89 
 
 
150 aa  193  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  64.29 
 
 
148 aa  193  8e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  64.29 
 
 
148 aa  193  8e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  67.65 
 
 
143 aa  193  8e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  66.43 
 
 
147 aa  193  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  65.03 
 
 
148 aa  192  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  64.23 
 
 
154 aa  192  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  63.01 
 
 
148 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  65.03 
 
 
148 aa  192  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  65.96 
 
 
148 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  64.54 
 
 
148 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  62.59 
 
 
156 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  64.54 
 
 
148 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  63.57 
 
 
154 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  63.19 
 
 
155 aa  191  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  64.54 
 
 
148 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  63.64 
 
 
145 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  62.33 
 
 
148 aa  191  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  64.23 
 
 
155 aa  191  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  63.57 
 
 
160 aa  190  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  3.16146e-08  unclonable  2.511e-08 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  65.22 
 
 
154 aa  190  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  67.67 
 
 
146 aa  190  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  67.39 
 
 
152 aa  190  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  62.04 
 
 
147 aa  190  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  59.6 
 
 
164 aa  189  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  64.49 
 
 
154 aa  189  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  62.24 
 
 
150 aa  189  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>