62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0608 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  100 
 
 
242 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  100 
 
 
242 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  100 
 
 
242 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  100 
 
 
242 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  100 
 
 
242 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  95.45 
 
 
242 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  71.07 
 
 
235 aa  341  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5944  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  69.42 
 
 
235 aa  336  2e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2660  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  69.01 
 
 
235 aa  336  3e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2533  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  69.01 
 
 
235 aa  335  4e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2003  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  69.83 
 
 
235 aa  333  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2613  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  69.83 
 
 
235 aa  333  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  65.86 
 
 
248 aa  308  3e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  63.24 
 
 
253 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  60.87 
 
 
253 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0685  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  67.36 
 
 
235 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.31708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  31.32 
 
 
213 aa  76.3  4e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.94 
 
 
193 aa  76.3  4e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.07 
 
 
182 aa  74.3  2e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.95 
 
 
243 aa  73.6  3e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.87 
 
 
187 aa  72.8  4e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.9 
 
 
198 aa  71.2  1e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.45 
 
 
224 aa  70.9  2e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.45 
 
 
224 aa  70.5  2e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.77 
 
 
204 aa  69.3  5e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  28.39 
 
 
232 aa  68.9  8e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.84 
 
 
197 aa  64.3  2e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.45 
 
 
154 aa  62  7e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.11 
 
 
154 aa  60.8  2e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.09 
 
 
148 aa  60.5  3e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.47 
 
 
178 aa  58.9  7e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.71 
 
 
156 aa  58.2  1e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.45 
 
 
213 aa  56.6  3e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  26.49 
 
 
176 aa  56.6  3e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.04 
 
 
176 aa  56.6  4e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  25.47 
 
 
161 aa  56.6  4e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.29 
 
 
147 aa  53.9  2e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.45 
 
 
151 aa  53.9  2e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.7 
 
 
202 aa  53.9  2e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.62 
 
 
216 aa  53.5  3e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  27.4 
 
 
148 aa  52.8  5e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.51 
 
 
154 aa  52.4  6e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.67 
 
 
152 aa  52  9e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.15 
 
 
148 aa  52  9e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.12 
 
 
155 aa  50.8  2e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.11 
 
 
153 aa  50.1  3e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.47 
 
 
158 aa  49.7  5e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.61 
 
 
151 aa  48.5  9e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.08 
 
 
151 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  26.14 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  25.49 
 
 
150 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.12 
 
 
151 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.36 
 
 
152 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.48 
 
 
157 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.03 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.84 
 
 
155 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  26.47 
 
 
176 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.74 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.49 
 
 
241 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.81 
 
 
249 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.49 
 
 
246 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>