More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1205 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
308 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  99.03 
 
 
308 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  96.42 
 
 
308 aa  611  1e-174  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  95.44 
 
 
308 aa  606  1e-172  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  95.1 
 
 
308 aa  602  1e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  94.79 
 
 
308 aa  602  1e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  95.11 
 
 
308 aa  603  1e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  95.11 
 
 
308 aa  603  1e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  95.1 
 
 
308 aa  602  1e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  93.49 
 
 
308 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  93.49 
 
 
308 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  91.23 
 
 
308 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  61.64 
 
 
311 aa  411  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  1.24662e-06 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  58.44 
 
 
314 aa  391  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  2.79611e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  58.8 
 
 
309 aa  384  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  60.81 
 
 
311 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  60.61 
 
 
354 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  58.44 
 
 
316 aa  378  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 
312 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  59.14 
 
 
319 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  59.47 
 
 
319 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  58.8 
 
 
327 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  56.54 
 
 
308 aa  374  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  57.98 
 
 
315 aa  374  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  57.52 
 
 
308 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
313 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
313 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  54.75 
 
 
313 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
313 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  54.43 
 
 
313 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  54.43 
 
 
313 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  54.43 
 
 
313 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  54.1 
 
 
313 aa  361  7e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
313 aa  360  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
313 aa  359  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  57.79 
 
 
309 aa  358  7e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
313 aa  358  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
313 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
313 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
313 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
313 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
313 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
313 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 
313 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  53.11 
 
 
313 aa  357  1e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
313 aa  357  1e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  56.42 
 
 
313 aa  357  1e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  56.08 
 
 
313 aa  356  2e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  53.67 
 
 
320 aa  355  6e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  53.67 
 
 
320 aa  355  6e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  55.89 
 
 
313 aa  354  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  52.13 
 
 
312 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2831  transcriptional regulator Cbl  53.9 
 
 
316 aa  352  5e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.01541e-08  normal  0.682702 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  52.67 
 
 
320 aa  352  5e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1658  transcriptional regulator Cbl  54.22 
 
 
316 aa  352  6e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  7.65107e-08  normal  0.0208007 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01886  hypothetical protein  54.22 
 
 
316 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01897  DNA-binding transcriptional activator of cysteine biosynthesis  54.22 
 
 
316 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000685239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1668  transcriptional regulator, LysR family  54.22 
 
 
316 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.12362e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1137  transcriptional regulator Cbl  54.22 
 
 
316 aa  349  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.42733e-08  hitchhiker  5.52963e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2269  transcriptional regulator Cbl  54.22 
 
 
316 aa  348  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  8.89139e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  54.05 
 
 
313 aa  348  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  55.07 
 
 
313 aa  345  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  53.38 
 
 
313 aa  345  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0971  transcriptional regulator Cbl  53.9 
 
 
316 aa  345  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000168411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2110  transcriptional regulator Cbl  53.9 
 
 
316 aa  344  9e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.31787e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  56.17 
 
 
314 aa  341  7e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  55.41 
 
 
314 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2705  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 
317 aa  339  3e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1289  transcriptional regulator CysB-like protein  54.61 
 
 
317 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  53.87 
 
 
335 aa  338  8e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  51.85 
 
 
324 aa  337  1e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1394  transcriptional regulator CysB-like protein  54.28 
 
 
317 aa  335  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2917  transcriptional regulator CysB-like protein  54.67 
 
 
317 aa  335  6e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  53.38 
 
 
306 aa  334  9e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  52.01 
 
 
333 aa  331  8e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  52.36 
 
 
324 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  4.6762e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  52.36 
 
 
324 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  1.99307e-11 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  52.36 
 
 
324 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  51.35 
 
 
324 aa  330  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  52.03 
 
 
324 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42013e-07 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1792  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 
317 aa  329  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  51.01 
 
 
326 aa  328  6e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2563  transcriptional regulator Cbl  54.4 
 
 
316 aa  327  1e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00294474  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  51.01 
 
 
324 aa  327  2e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  50.66 
 
 
323 aa  327  2e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  49.67 
 
 
325 aa  326  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  51.69 
 
 
324 aa  325  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  51.35 
 
 
324 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1497  transcriptional regulator CysB  50 
 
 
324 aa  323  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.66035e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01945  transcriptional regulator CysB  51 
 
 
324 aa  322  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  51.01 
 
 
324 aa  322  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  51.35 
 
 
324 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  52.03 
 
 
326 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  51.01 
 
 
324 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>