103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4609 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  804    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  68.97 
 
 		 392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  67.26 
 
 		 393 aa  555  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  67.87 
 
 		 388 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  61.76 
 
 		 394 aa  501  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  61.73 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  58.02 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  61.18 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  60.47 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  56.33 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  47.12 
 
 		 416 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  46.51 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  46.51 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  43.95 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  46.49 
 
 		 414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  42.54 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  45.61 
 
 		 413 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  42.68 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  41.81 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  43.45 
 
 		 414 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  42.96 
 
 		 414 aa  319  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  44.1 
 
 		 419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  42.82 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  44.1 
 
 		 419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.83 
 
 		 422 aa  249  5e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  40.15 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  39.95 
 
 		 422 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  37.26 
 
 		 421 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  37.53 
 
 		 420 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  34.78 
 
 		 405 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  38.59 
 
 		 409 aa  233  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  38.31 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  37.5 
 
 		 410 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  38.31 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  38.31 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  37.56 
 
 		 421 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.95 
 
 		 430 aa  222  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  38.04 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.75 
 
 		 410 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  36.87 
 
 		 408 aa  212  7.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  35.9 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  37.91 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  36.19 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  36.63 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.19 
 
 		 390 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  37.19 
 
 		 398 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  36.39 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  35.34 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  34.96 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  34.54 
 
 		 404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  36.52 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  33.17 
 
 		 377 aa  176  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  30.66 
 
 		 502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  31.47 
 
 		 436 aa  135  9e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  28.71 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  26.7 
 
 		 498 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  28.8 
 
 		 1506 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  32.12 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  25.19 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  34.04 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  26.58 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  36.17 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  34.9 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  34.53 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  29.71 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  33.1 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  28.18 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  26.79 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  32.02 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  30.81 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  30.81 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  30.81 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  29.28 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  29.32 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  31.16 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  30.94 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  30.94 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  28.19 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  30 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  22.62 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  26.81 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  25.37 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  33.11 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  23.7 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  24.64 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  26.45 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  24.64 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  28.81 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  26.23 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  26.23 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  28.99 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  28.79 
 
 		 574 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  25.81 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  24.06 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  28.99 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  24.06 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  25.81 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  23.81 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  27.91 
 
 		 1166 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>