35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1742 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 131 aa  262  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  65.89 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  60.16 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  58.59 
 
 		 149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  37.29 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  39.2 
 
 		 141 aa  84.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  37.21 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  35 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  30.85 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  33.85 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  32.52 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  37.93 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  24.19 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  31.63 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  26.67 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  27.91 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  33.07 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  24.76 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  32.11 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  32.43 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.262542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>