51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3371 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  276  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5224  hypothetical protein  43.7 
 
 		 148 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  37.4 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  33.09 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2545  protein of unknown function DUF1486  29.85 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  29.77 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  30.65 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  31.58 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  27.27 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1719  protein of unknown function DUF1486  30.95 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1646  protein of unknown function DUF1486  30.95 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.081161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0295  protein of unknown function DUF1486  31.75 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  26.42 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  28.95 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1283  protein of unknown function DUF1486  32.08 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  26.47 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0441  hypothetical protein  26.5 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4914  hypothetical protein  26.52 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4210  hypothetical protein  26.77 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4925  hypothetical protein  25.76 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6384  hypothetical protein  27.82 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  26.55 
 
 		 186 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  24.26 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  24.26 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2990  hypothetical protein  29.63 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2307  protein of unknown function DUF1486  29.17 
 
 		 204 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0249  hypothetical protein  32.29 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000330917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1882  hypothetical protein  27.72 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1546  hypothetical protein  27.72 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1729  hypothetical protein  27.72 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0373687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0955  hypothetical protein  27.72 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0209  hypothetical protein  27.72 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0131745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1104  hypothetical protein  27.72 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0489751  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  26.14 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1703  hypothetical protein  27.72 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3219  protein of unknown function DUF1486  31.43 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247367  hitchhiker  0.000405951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2604  hypothetical protein  27.72 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  28.15 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  26.4 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3428  limonene-1,2-epoxide hydrolase  22.31 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5540  protein of unknown function DUF1486  32.79 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  29.27 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  35.71 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1447  hypothetical protein  26.32 
 
 		 185 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0560331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1354  hypothetical protein  23.89 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02563  hypothetical protein  26.5 
 
 		 331 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1394  hypothetical protein  23.89 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  26.51 
 
 		 85 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>