More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0228 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  100 
 
 		 353 aa  725    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  77.05 
 
 		 349 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  66.08 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  64.2 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  61.16 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  56.47 
 
 		 327 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  56.63 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  53.68 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  55.62 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  55.34 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  57.3 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  55.65 
 
 		 362 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  50.55 
 
 		 379 aa  359  3e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  50.28 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  54.79 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  54.03 
 
 		 349 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  46 
 
 		 344 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  46.59 
 
 		 342 aa  312  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  47.06 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  47.67 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  45.38 
 
 		 362 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  67.63 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  43.28 
 
 		 338 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  58.82 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  38.44 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  39.02 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  53.17 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  37.76 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  37.83 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  39.31 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  36.99 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  36.95 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  36.95 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  36.47 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  37.72 
 
 		 323 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  37.89 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  38.78 
 
 		 349 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  37.86 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  34.41 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  37.94 
 
 		 361 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  37.68 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  37.9 
 
 		 350 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  36.72 
 
 		 353 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.07 
 
 		 345 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  37.61 
 
 		 347 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.47 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.72 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  33.78 
 
 		 388 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  35.67 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  32.75 
 
 		 399 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.17 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  31.91 
 
 		 401 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.27 
 
 		 329 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  34.99 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  32.32 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  31.65 
 
 		 403 aa  189  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  33.9 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  33.9 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  33.52 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  37.93 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  31.58 
 
 		 405 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  32.91 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  32.07 
 
 		 406 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.95 
 
 		 332 aa  186  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 		 422 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.63 
 
 		 320 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  33.89 
 
 		 360 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2441  cobalamin synthesis protein P47K  30.83 
 
 		 416 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.39 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  42.08 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  44.02 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  31.9 
 
 		 404 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  32.46 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  35.71 
 
 		 354 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.16 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  31.81 
 
 		 406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  32.06 
 
 		 401 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  30.45 
 
 		 405 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  42 
 
 		 460 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  30.65 
 
 		 400 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  31.05 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  29.77 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  30.65 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  32.14 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  41.38 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  29.9 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  41.95 
 
 		 457 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  31.14 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  32.51 
 
 		 373 aa  179  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  31.03 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  32.78 
 
 		 358 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  34.7 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.3 
 
 		 316 aa  179  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.3 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  34.02 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  31.55 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>