22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3163 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  33.56 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1074  hypothetical protein  35.41 
 
 
269 aa  162  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  35.89 
 
 
282 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  33.98 
 
 
271 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0477  hypothetical protein  34.12 
 
 
279 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  26.32 
 
 
283 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3592  hypothetical protein  23.88 
 
 
275 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  24.48 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1975  hypothetical protein  22.73 
 
 
268 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2859  hypothetical protein  27.14 
 
 
274 aa  56.2  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0517  hypothetical protein  30.66 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2568  hypothetical protein  28.81 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2871  hypothetical protein  23.28 
 
 
285 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0990  hypothetical protein  27.2 
 
 
303 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10358  hypothetical protein  27.21 
 
 
272 aa  46.6  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.834862  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0452  hypothetical protein  23.81 
 
 
268 aa  46.6  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000310711  decreased coverage  0.00000000190232 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  25.71 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  24.65 
 
 
247 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  24.65 
 
 
247 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  30.19 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  26.96 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>