20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2625 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  634    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0990  hypothetical protein  48.65 
 
 
303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2031  hypothetical protein  28.37 
 
 
345 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1841  hypothetical protein  31.37 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2378  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  25.76 
 
 
407 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  23.12 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3873  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  29.63 
 
 
322 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0071  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  28.1 
 
 
341 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2880  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  24.42 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2622  hypothetical protein  26.32 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2765  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  26.74 
 
 
331 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  24.29 
 
 
284 aa  46.2  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  21.6 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0961  hypothetical protein  23.75 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.596484  normal  0.311554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0451  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  26.17 
 
 
385 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824253  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  30.19 
 
 
323 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1074  hypothetical protein  24.57 
 
 
269 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3592  hypothetical protein  23.61 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  22.54 
 
 
271 aa  42.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  24.84 
 
 
405 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>