17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2880 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2880  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  100 
 
 
366 aa  709    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2771  hypothetical protein  47.31 
 
 
348 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0071  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  44.4 
 
 
341 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2031  hypothetical protein  42.77 
 
 
345 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3873  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  42.7 
 
 
322 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2622  hypothetical protein  42.59 
 
 
365 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0451  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  42.01 
 
 
385 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824253  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2765  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  45.96 
 
 
331 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03550  protein of unknown function (DUF916)  40.47 
 
 
356 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2378  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  34.27 
 
 
407 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4774  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  44.02 
 
 
334 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0090  hypothetical protein  36.12 
 
 
382 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1841  hypothetical protein  38.91 
 
 
292 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01080  protein of unknown function (DUF916)  37.55 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8823  hypothetical protein  31.62 
 
 
388 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388128  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3130  hypothetical protein  30.65 
 
 
314 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.38171  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  24 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>