19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1497 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0477  hypothetical protein  53.11 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  48.78 
 
 
284 aa  270  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1074  hypothetical protein  48.75 
 
 
269 aa  262  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  47.23 
 
 
271 aa  249  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  35.89 
 
 
323 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  31.39 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0517  hypothetical protein  28.21 
 
 
199 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0990  hypothetical protein  25.97 
 
 
303 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1975  hypothetical protein  24.81 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  26.4 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  25 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  26.37 
 
 
241 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3592  hypothetical protein  24.56 
 
 
275 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  21.6 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1627  hypothetical protein  26.4 
 
 
543 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  24.53 
 
 
250 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3533  hypothetical protein  23.7 
 
 
326 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.812753  normal  0.731535 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1700  hypothetical protein  24.06 
 
 
541 aa  42.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>