17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1096 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  584  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  37.21 
 
 
271 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1074  hypothetical protein  36.86 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  33.45 
 
 
284 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  31.39 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0477  hypothetical protein  29.55 
 
 
279 aa  130  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  26.32 
 
 
323 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  24.18 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  23.12 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3592  hypothetical protein  22.82 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1975  hypothetical protein  23.76 
 
 
268 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  24.54 
 
 
263 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2031  hypothetical protein  25.38 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2378  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  29.29 
 
 
407 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2622  hypothetical protein  23.89 
 
 
365 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2985  hypothetical protein  26.32 
 
 
336 aa  42.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0451  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  20.45 
 
 
385 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>