23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1260 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  52.96 
 
 
271 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  48.78 
 
 
282 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1074  hypothetical protein  45.04 
 
 
269 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0477  hypothetical protein  41.92 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  33.45 
 
 
283 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  33.56 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0517  hypothetical protein  30.09 
 
 
199 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1975  hypothetical protein  25.91 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0990  hypothetical protein  25.95 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  27.98 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0452  hypothetical protein  28.8 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000310711  decreased coverage  0.00000000190232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  25.65 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1287  hypothetical protein  27.59 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  22.4 
 
 
263 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1700  hypothetical protein  24.2 
 
 
541 aa  46.6  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3592  hypothetical protein  27.22 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  24.29 
 
 
319 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  25.58 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  28 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2859  hypothetical protein  28.47 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  27.15 
 
 
260 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1756  hypothetical protein  26.57 
 
 
291 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>