15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0452 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0452  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  548  1e-155  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000310711  decreased coverage  0.00000000190232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  32.05 
 
 
279 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  30.57 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1756  hypothetical protein  27.87 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1287  hypothetical protein  26.62 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10358  hypothetical protein  26.44 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.834862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0698  hypothetical protein  27.94 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0782955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1214  hypothetical protein  24.7 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2871  hypothetical protein  27.39 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4915  hypothetical protein  24.49 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00458522  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2859  hypothetical protein  28.5 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2568  hypothetical protein  27.16 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  28.8 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  23.81 
 
 
323 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  23.96 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>