16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1756 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1756  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1287  hypothetical protein  76.29 
 
 
291 aa  461  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  42.26 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4915  hypothetical protein  38.49 
 
 
276 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00458522  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2859  hypothetical protein  38.62 
 
 
274 aa  139  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  31.25 
 
 
279 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2871  hypothetical protein  31.78 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10358  hypothetical protein  29.34 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.834862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2568  hypothetical protein  28.87 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1214  hypothetical protein  27.39 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0452  hypothetical protein  27.87 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000310711  decreased coverage  0.00000000190232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0698  hypothetical protein  24.56 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0782955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1304  hypothetical protein  26.21 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06481  hypothetical protein  31.33 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1305  hypothetical protein  24.14 
 
 
254 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  26.57 
 
 
284 aa  42.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>