13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2550 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  532  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  24.18 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  24.87 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  24.48 
 
 
323 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  33.78 
 
 
287 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10358  hypothetical protein  25.75 
 
 
272 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.834862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  29.59 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1074  hypothetical protein  19.6 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  26.4 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  22.4 
 
 
284 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0765  hypothetical protein  32.71 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2568  hypothetical protein  26.88 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  24.64 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>