12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0477 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0477  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  573  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  53.11 
 
 
282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  41.92 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1074  hypothetical protein  38.15 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  37.3 
 
 
271 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  34.12 
 
 
323 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  29.55 
 
 
283 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1975  hypothetical protein  24.7 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0517  hypothetical protein  26.96 
 
 
199 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0990  hypothetical protein  27.27 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  27.97 
 
 
901 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  22.08 
 
 
319 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>