14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1074 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1074  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  553  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  57.53 
 
 
271 aa  318  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  48.75 
 
 
282 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1260  hypothetical protein  45.04 
 
 
284 aa  261  8.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0477  hypothetical protein  38.15 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  36.86 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  35.41 
 
 
323 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3592  hypothetical protein  23.81 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0517  hypothetical protein  29.2 
 
 
199 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1975  hypothetical protein  26.03 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0990  hypothetical protein  24.31 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  19.6 
 
 
263 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  29.07 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  23.23 
 
 
319 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>