16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10358 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10358  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  553  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.834862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4915  hypothetical protein  34.12 
 
 
276 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00458522  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1287  hypothetical protein  30.1 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2859  hypothetical protein  29.96 
 
 
274 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  31.12 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1756  hypothetical protein  29.34 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  31.99 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2568  hypothetical protein  26.59 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1214  hypothetical protein  26.69 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0452  hypothetical protein  26.44 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000310711  decreased coverage  0.00000000190232 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2871  hypothetical protein  25.25 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0698  hypothetical protein  23.18 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0782955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1305  hypothetical protein  25.17 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  25.75 
 
 
263 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  27.21 
 
 
323 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1304  hypothetical protein  30.43 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>